Sterilizacija v zobozdravstvu je zelo pomembna, zobozdravniki in zobozdravniki pa običajno očistijo in razkužijo večino površin v svojih ordinacijah in prostorih za zdravljenje, da preprečijo širjenje mikrobov. Kadar je le mogoče, se uporabljajo tudi zobozdravstveni pripomočki za enkratno uporabo. Orodja, ki niso za enkratno uporabo, se običajno očistijo ročno in dajo v stroj, znan kot avtoklav. Ta stroj nato razkuži orodje tako, da ga poškropi s paro pod zelo visokim pritiskom, ki ubije večino mikroorganizmov. Vsa orodja, ki jih ni mogoče izpostaviti visoki vročini ali vlagi, se običajno razkužijo s kemikalijami.
Ker se veliko mikrobov lahko prenese preprosto z dotikom kontaminiranih površin, so zobozdravniki in zobozdravstveni asistenti običajno zelo previdni pri razkuževanju površin v svojih pisarnah in sobah za zdravljenje. Trdne površine, kot so pulti in umivalniki, se običajno obrišejo z antibakterijskim razpršilom. Zobni stoli so običajno prekriti tudi s papirnatimi prevlekami za enkratno uporabo, ki jih po vsakem pacientu zavržemo. Zobozdravniki in njihovi pomočniki običajno nosijo tudi zaščitne pregrade, kot so rokavice in obrazne maske, da preprečijo širjenje klic na svoje paciente.
Zobni pripomočki in pripomočki za enkratno uporabo so nekateri najpomembnejši predmeti, ko gre za sterilizacijo v zobozdravstvu. Nekateri zobozdravstveni pripomočki za enkratno uporabo vključujejo oprsnice in maske, zavite v sterilno embalažo. Ko jih uporabimo pri enem bolniku, jih preprosto zavržemo.
Orodja, ki jih ni mogoče zavreči, kot so zobni vrtalni stroji, se običajno opravijo skozi zelo intenziven postopek zobne sterilizacije. Najprej jih običajno močno postrgamo z rokami. To se običajno naredi z vročo vodo in detergentom in pomaga odstraniti vse velike delce, kot so zobne obloge. Lahko jih postavite tudi v vibrirajoči pladenj, napolnjen s čistilno raztopino, ki lahko pomaga odstraniti zelo majhne delce.
Sterilizacija v zobozdravstvu vključuje tudi uničenje nevidnih mikrobov na orodjih. Avtoklavi so stroji, ki se običajno uporabljajo med sterilizacijo v zobozdravstvu. Ti stroji so običajno narejeni iz velikih kovinskih jeklenk in so podobni loncu na pritisk. Ko je orodje vstavljeno v avtoklav, ga poškropimo z visokotlačno paro. Visok tlak v tem stroju pomaga dvigniti paro na zelo visoke temperature, ki so potrebne za uničenje mikroorganizmov, ki povzročajo bolezni.
Vsa orodja, ki jih ni mogoče izpostaviti vlagi ali intenzivni vročini, je treba sterilizirati z drugimi metodami. Kemikalije se med sterilizacijo pogosto uporabljajo tudi v zobozdravstvu. Nekatere kemikalije, ki se uporabljajo za uničenje klic in sterilizacijo zobnih pripomočkov, so običajno na osnovi joda ali alkohola, saj sta obe kemikaliji zelo učinkoviti pri ubijanju mikrobov.