Najpogostejšim vprašanjem finančnega računovodstva se je le redko težko izogniti, vendar jih je težko premagati, ko so enkrat ustvarjene. Neustrezno vodenje evidenc, goljufivo vodenje evidenc in nenadzorovano upravljanje denarnih tokov lahko vodijo v propad podjetja. Tako zaradi neustreznega vodenja evidenc kot zaradi goljufivega vodenja evidence so poslovne evidence izjemno nezanesljive, iskanje in popravljanje vseh napak pa je lahko zamudno in drago. Omejen denarni tok ali brez njega, znan tudi kot obratni kapital, lahko vodi tudi do resnih posledic, ki se jim je najbolje izogniti. Celo velika podjetja se lahko uničijo z neustreznim finančnim računovodstvom, in to so v preteklosti.
Med najpogostejšimi vprašanji finančnega računovodstva je nepravilno vodenje evidenc. Brez popolne evidence prihodkov in porabljenega denarja je finančno poročilo v najboljšem primeru nezanesljivo. To je morda najpogostejša napaka malega podjetja. Neustrezna ali nepopolna evidenca vnosa in odhoda denarja lahko povzroči napake pri davku na dohodek in hude vladne kazni, ki se običajno uporabljajo leta po tem. Večina podjetij lahko koristi, če njihove evidence redno pregleduje neodvisni revizor, ki je računovodja, ki ni povezan s podjetjem, ki lahko zagotovi, da se evidence pravilno vodijo.
Podjetje, ki zanemarja vodenje evidenc, lahko lažje postane žrtev goljufivih finančnih računovodskih težav. To težavo lahko ustvari zaposleni, ki prijavi lažno prodajo, da bi vzel blago, kot so darilne kartice. Zaradi pogostih poročil o lažni prodaji se zdi, kot da podjetje raste, medtem ko dejansko izgublja denar. Zaposleni so sposobni ogroziti podjetje tudi na druge finančne načine, a dobro vodenje evidence bo zmanjšalo težave na minimum, tat pa je mogoče hitreje ujeti.
Druge finančne računovodske težave vključujejo slabo upravljanje in analizo denarnih tokov. Čeprav je definicija denarnega toka različna, se na splošno nanaša na gibanje denarja v podjetje ali iz njega. Včasih podjetje propade zgolj zaradi negativnega denarnega toka. Podjetje bi lahko bilo dolgoročno dobičkonosno, vendar ni moglo pokriti neposrednih stroškov, kot so plače zaposlenih, potrebna oprema in državni davki. Natančno spremljanje denarnega toka je ključnega pomena za uspeh novih in starih podjetij.
Obstajajo številne finančne računovodske težave, ki se lahko pojavijo, nekatere manj pogoste kot druge. Neodvisni revizor lahko zagotovi še en niz oči, da zagotovi, da je na finančni strani podjetja vse v redu. Ti strokovnjaki se rutinsko uporabljajo za preprečevanje velikih in majhnih nesreč.