Vrtnice lahko razvijejo bolezni, ki poškodujejo cvetove in listje. Črna pegavost, ožig Botrytis in pepelasta plesen so pogoste bolezni vrtnic, ki jih povzročajo glive. Rožnata rja, druga glivična bolezen, povzroča rdeče lise, podobne rji na listju. Mozaik vrtnic je bolezen, ki pogosto napada vrtnice in jo povzroča virus. Kronski žolč je še ena bolezen, ki napada vrtnice na njihovih olesenelih predelih stebla.
Črna pegavost je ena najpogostejših bolezni vrtnic, ki jo povzročajo glive. Gliva lahko miruje, dokler visoke temperature, pomešane z vlago, ne povzročijo širjenja glive. Bolezen črnih madežev povzroča črne kolobarje na listju in steblih ter se zdravi s protiglivičnimi milnimi pršili.
Opel botritis povzroča gliva, ki napada razvijajoče se cvetne brste. Vrtnica, okužena s to boleznijo, prezgodaj odvrže razvijajoče se popke in obstoječi popki na rastlini porjavijo. Ko je vrtnica okužena z ožigom Botrytis, je treba ves okuženi rastlinski material odstraniti in uničiti.
Pepelasta plesen napada tudi vrtnice, zaradi česar se razvijajoči listi in brsti posušijo in obarvajo. Obrezovanje okuženega materiala pomaga preprečiti širjenje bolezni. Zgodnje stopnje bolezni je mogoče zdraviti s fungicidnimi razpršili.
Pogoste bolezni vrtnic vključujejo tudi rožno rjo. To bolezen povzroča glivična okužba, ki na spodnji strani listov vrtnic povzroči rjo podobne lise, zgodnje odkrivanje pa lahko prepreči širjenje bolezni na zgornje strani listov. Rožno rjo je mogoče uspešno zdraviti s fungicidnimi razpršili, če jo ujamemo in zdravimo zgodaj.
Mozaik vrtnic je ena najpogostejših bolezni vrtnic, ki jih povzroča virus. Virus napade listje in povzroči rumeno obarvanje in upočasnjeno rast. Mozaik vrtnic se širi s cepljenjem okuženih rastlin na neokužene rastline. Ker se bolezen ne širi sama od rastline do rastline, lahko vrtnice z rožnim mozaikom pustite na vrtu. Edini način, da se znebite bolezni, pa je odstranitev okužene rastline.
Druga bolezen, imenovana kronski žolč, je ena izmed pogostih bolezni vrtnic, ki napada stebla rastlin vrtnic. Povzroča ga bakterija, ki napada vrtnice in druge rastline z olesenelimi stebli. Bolezen se med rastlinami širi z uporabo škarij, ki so okužene z bakterijami. Vrtnice in druge lesnate rastline bodo verjetno razvile žolč na območjih, ki so poškodovana ali na mestu obrezovalne rane. Da preprečite širjenje, je treba po delu na okuženi rastlini sanirati škarje za obrezovanje.