Rastlinjak je mogoče prezračevati na različne načine, vendar so nekatere metode učinkovitejše od drugih. Najboljši načini prezračevanja rastlinjakov omogočajo nežno osvežitev zraka, ne da bi pri tem motili nežno vegetacijo v notranjosti. Eden najpreprostejših načinov prezračevanja je strešna ali stenska zračnica, ki omogoča pretok naravnega vetra skozi strukturo. Prezračevalne odprtine, ki se samodejno odpirajo in zapirajo, so tudi dober način prezračevanja rastlinjakov. Ventilatorji za izpušne in notranje kroženje so lahko učinkovit način za prezračevanje rastlinjaka.
En sam prezračevalni ventil, nameščen v steno ali streho, je eden najcenejših in najboljših načinov prezračevanja rastlinjakov. Ta vrsta zračnika omogoča pretok svežega zraka skozi konstrukcijo skozi odprta vrata ali okna. Ta način prezračevanja rastlinjakov omogoča postopno pretok zraka skozi prostor ter odvajanje toplote in vlage. Večji rastlinjaki običajno zahtevajo vrsto zračnikov, ki so strateško postavljeni vzdolž strehe ali sten. Stenske prezračevalne odprtine je mogoče ročno odpreti, da zagotovite dodaten pretok zraka, ko ne piha vetrič.
Samodejne prezračevalne odprtine se odprejo in zaprejo, ko temperatura v rastlinjaku doseže določeno raven. Ta način prezračevanja rastlinjakov deluje brez električne energije. Pritrjen cilinder samodejno odpre zračnico, ko se okoli njega nabere zadostna količina toplote. Odprtina se ponovno zapre, ko se zrak v rastlinjaku ohladi. Električno upravljane avtomatske zračnike nadzoruje termostat ali vlažidistat, ki je prednastavljen na določeno temperaturo ali raven vlažnosti.
Izpušni ventilatorji lahko zagotovijo tudi prezračevanje rastlinjaka tako, da vlečejo zunanji zrak skozi konstrukcijo, ko ni naravnega vetra. Ti ventilatorji so običajno nameščeni nasproti vrat, da omogočijo, da zrak popolnoma teče skozi strukturo. Ker zrak iz izpušnega ventilatorja piha navzven, ne moti občutljivih rastlin. Majhne rastlinjake je običajno mogoče prezračevati samo z eno stensko enoto. Večje strukture lahko zahtevajo enega ali več velikih izpušnih ventilatorjev, nameščenih na vsakem koncu z loputami v stranskih stenah.
Izpušni ventilatorji se lahko krmilijo ročno ali samodejno s termostatom ali vlažilnikom. Za zmanjšanje porabe energije je mogoče kupiti tudi izpušne ventilatorje na sončno energijo. Te enote imajo višje začetne stroške, vendar se običajno sčasoma plačajo z znižanjem stroškov električne energije. Nekateri rastlinjaki uporabljajo notranji ventilator v kombinaciji z izpušnim ventilatorjem za nadaljnje kroženje zraka in znižanje temperature in vlažnosti. Ta metoda prezračevanja rastlinjakov pomaga tudi pri spodbujanju opraševanja med nekaterimi vrstami rastlin.