Osnovni učinek amilaze na prebavo je razgradnja vezi v škrobu na manjši disaharid maltozo, ki se v tankem črevesu nadalje razgradi v glukozo, ki jo telo lahko absorbira. Brez amilaze se večina ogljikovih hidratov, ki jih ljudje zaužijejo, ne bi predelala in količina energije, ki bi jo ljudje lahko dobili, bi bila dramatično omejena. Zaradi tega je amilaza eden najpomembnejših prebavnih encimov.
Da bi razumeli vlogo amilaze pri prebavi, je treba najprej razumeti, da so škrobi polimeri glukoze, ki so preveliki, da bi jih telo zlahka absorbiralo. Da bi bil koristen, je treba škrob, ki je ogljikov hidrat, razbiti na manjše dele – torej na preprostejši sladkor. Amilaza to naredi na dveh delih telesa.
Učinek amilaze na prebavo se začne takoj v ustih. Ko človek žveči hrano, njegove žleze slinavke sproščajo amilazo. Z zobmi in jezikom amilaza začne razgrajevati škrob v disaharid maltozo, ki je dve molekuli glukoze, ki sta povezani skupaj. Vse, kar je v prežvečenem grižljaju hrane, vključno z maltozo in amilazo, potuje po požiralniku v želodec.
Potencialna raven vodika (pH) v želodcu je preveč kisla, da bi amilaza lahko še naprej razgrajevala vezi v škrobu, ki jih je treba še razgraditi. Na tej točki se vloga amilaze pri prebavi ustavi. Želodčna kislina v želodcu deluje skupaj z encimi, kot je amilaza, da nadaljuje proces prebave in hrano spremeni v tekočino, ki zlahka prehaja v tanko črevo.
Velik del škroba, ki ga ljudje zaužijejo, ni popolnoma razgrajen s amilazo v slini ali želodčno kislino – hrana ne ostane v ustih dovolj dolgo, da bi se vse vezi porušile, želodčna kislina pa je boljša pri ciljanju na beljakovine namesto na ogljikove hidrate. Nato trebušna slinavka izloča tudi amilazo, ki potuje v tanko črevo. Tam amilaza trebušne slinavke cilja na preostali škrob in tvori več maltoze.
Ko amilaza trebušne slinavke razgradi čim več škroba v maltozo, je učinek amilaze na prebavo popoln. Maltoza se še vedno ne absorbira zlahka, zato drugi encim, ki nastane v tankem črevesu, maltaza, konča razgradnjo vezi v disaharidih. Rezultat je glukoza, ki jo resice v tankem črevesu lahko absorbirajo. Telo uporablja glukozo kot primarni vir energije.