Neželeni učinki inulina običajno vključujejo prebavni sistem. Nekateri ljudje lahko občutijo bolečine v želodcu in plin, če zaužijejo preveč inulina. Drugi pogosti neželeni učinki vključujejo občutek slabosti in driske. Običajno se neželeni učinki pojavijo, če ljudje nevede jedo hrano z dodanim inulinom ali jemljejo dodatke inulina. Inulin lahko pri nekaterih ljudeh povzroči alergijsko reakcijo.
Inulin je vrsta ogljikovih hidratov. V naravi ga najdemo v številni zelenjavi in sadju, kot sta čebula in banane. Ogljikovi hidrati veljajo za vrsto topnih vlaknin, saj jih prebavni sistem ne absorbira. Namesto tega spodbuja rast zdravih bakterij v črevesju. Ker sama po sebi ni bakterija, ampak vpliva na število bakterij v telesu, velja za prebiotik.
Neželeni učinki inulina se običajno pojavijo le, če oseba čez dan zaužije preveč vlaknin. Testi in študije so pokazale, da so ljudje pokazali neželene učinke inulina na prebavila, ko so ga zaužili več kot 10 gramov na dan. Tipični neželeni učinki, o katerih so poročali pri uporabi inulina, so vključevali krče v želodcu, šumenje v želodcu in drisko. Nekateri ljudje so poročali o občutkih napihnjenosti, plina in napenjanja.
Številni proizvajalci živil dodajajo inulin živilom, kot so žitarice ali jogurt, da povečajo vsebnost vlaknin, ne da bi hrana postala grenka. Inulin ima običajno sladek okus, zato ga dodajanje hrani ne le poveča vlaknine, ampak lahko izboljša tudi okus hrane. Ker vedno več proizvajalcev živilom dodaja vlaknine, raste tveganje za stranske učinke inulina, saj lahko ljudje zaužijejo več, kot je bilo predvideno, ne da bi se tega zavedali.
Inulin je na voljo tudi kot dodatek ali injekcija in je zasnovan tako, da pomaga pri lajšanju zaprtja ali zmanjšanju ravni trigliceridov, saj preprečuje, da bi telo absorbiralo trigliceride. Nekateri ljudje verjamejo, da lahko pomaga znižati holesterol ali pomaga bolnikom pri izgubi teže. Če se inulin uporablja v skladu z navodili kot dodatek, so stranski učinki inulina običajno nizki ali sploh ne obstajajo.
Nekateri ljudje so lahko alergični na inulin. Znaki alergijske reakcije so različni, odvisno od resnosti alergije. Pogoste alergijske reakcije vključujejo kašelj ali težave z dihanjem po zaužitju hrane, ki vsebuje vlaknine, tudi zelenjave, ki naravno vsebuje inulin. Ker se vlaknine dodajajo vedno več živilom, se lahko poveča pojav alergijskih reakcij.