Simptomi odtegnitve klonidina so številni in segajo od blage želodčne motnje do močnega in nevarnega zvišanja krvnega tlaka. Dodatni učinki so glavoboli, težave s spanjem, spremembe vida in gripi podobni občutki. Bolniki lahko razvijejo druge moteče znake, kot so tresenje, zvišana telesna temperatura, halucinacije in skrajna tesnoba. Te reakcije je mogoče preprečiti s počasnim zmanjševanjem odmerka zdravila, ponovna uvedba nenadoma ukinjenega zdravila pa lahko ustavi hude simptome.
Na splošno bodo bolniki doživeli odtegnitev klonidina le, če nenadoma prenehajo jemati zdravilo brez vodenega zniževanja. To pomeni, da vsak, ki jemlje to zdravilo, potrebuje nasvet zdravnika, kako ga varno prekiniti. Pomembno je poudariti, da lahko celo kratkotrajna uporaba povzroči odtegnitev. Vsi bolniki, ki jemljejo zdravilo, morajo imeti zdravnikov načrt postopnega zmanjšanja za prekinitev.
Ena največjih skrbi, povezanih z odtegnitvijo, je, da lahko povzroči hipertenzivno krizo. Zdravilo znižuje in uravnava krvni tlak. Njegova nenadna odsotnost lahko povzroči nevarno visoke ravni krvnega tlaka, ki so občasno usodne. Drugi hudi simptomi nenadne prekinitve so halucinacije, huda slabost in/ali bruhanje ter globoke spremembe razpoloženja. To zadnje je lahko še posebej tvegano za ljudi s stanji, kot je bipolarna motnja.
Čeprav mnogi ljudje ne bodo imeli najhujših odtegnitvenih simptomov, lahko raznolikost teh reakcij povzroči izjemno nelagodje. Ker bolniki prenehajo jemati zdravilo, lahko to negativno vpliva na razpoloženje, telesno temperaturo, delovanje želodca in kognicijo. Z drugimi besedami, ljudje se lahko počutijo zelo slabo, ko nenadoma prenehajo jemati, in ti občutki lahko trajajo več dni ali dlje. Poleg tega je težko napovedati izid odtegnitve in skoraj nemogoče ugotoviti, ali bodo bolniki verjetno imeli življenjsko nevarne reakcije.
Namesto da bi bolnikom dovolili odtegnitev klonidina, zdravniki običajno izdelajo postopen načrt prekinitve zdravljenja. Zoženje lahko traja od nekaj dni do nekaj tednov. V glavnem vključuje dajanje postopoma padajočih odmerkov vsak dan, da bi se izognili negativnim simptomom. Konkretno količino dnevnega zmanjšanja je mogoče spremeniti, če bolnik začne doživljati odtegnitev. Tudi, ko so ljudje nenadoma prenehali jemati klonidin, lahko ponovna uvedba zdravljenja z zdravilom ustavi večino negativnih simptomov.
Ironično je, da je klonidin uporabno zdravilo za odtegnitev od drugih vrst zdravil, kot so benzodiazepini in opiati. Pomaga odpraviti negativne simptome, ki se lahko pojavijo, ko ljudje prenehajo jemati te snovi. Če se uporablja v ta namen, zdravljenje običajno traja le nekaj dni do enega tedna. Ker pa lahko ti isti bolniki trpijo tudi za odtegnitvijo klonidina, se zdravilo na koncu zdravljenja pogosto zmanjša, da bi se izognili tem simptomom.