Neželeni učinki zdravil za ščitnico bodo odvisni od stanja, ki ga zdravimo, vendar najpogosteje vključujejo hiter srčni utrip, palpitacije, omotico, nestrpnost do mraza ali vročine, izpadanje las in spremembe telesne teže. Te težave lahko pomenijo, da je odmerek zdravila previsok ali prenizek. V večini primerov je te težave mogoče odpraviti s spreminjanjem odmerka, dokler ni delovanje ščitnice normalno in simptomi ne izginejo.
Obstajata dve glavni težavi, povezani s ščitnico. Prvi je hipotiroidizem, kar pomeni, da ščitnica ne proizvaja dovolj hormonov in deluje počasi ali počasi. Hipertiroidizem je nasproten problem, kar pomeni, da ščitnica proizvaja preveč hormonov in se šteje za hiperaktivno. Oboje lahko močno vpliva na telo, saj ščitnica pomaga uravnavati hormonsko ravnovesje različnih sistemov in organov.
Neželeni učinki zdravil za ščitnico lahko vključujejo simptome hipertiroidizma, kot so izguba teže ali občutek vročine, ko preveč ali prehitro pospeši delovanje ščitnice. Večino časa to zahteva le prehod bolnika na nižji odmerek. V drugih primerih bo morda treba odmerek zdravila povečati, če simptomi počasne ščitnice ne prenehajo.
Enako se lahko zgodi z zdravili za hipertiroide. Včasih ščitnica postane prepočasna ali počasna, bolniki pa se lahko zredijo in občutijo utrujenost in nestrpnost do mraza. Popravek odmerka lahko deluje pri večini neželenih učinkov zdravil za ščitnico, včasih pa bo morda potrebno popolnoma novo zdravilo. Nekateri bolniki bodo morda morali preizkusiti več možnosti, preden se najde najboljša.
Če stranski učinki zdravil za ščitnico ne izginejo niti ob pravilni prilagoditvi odmerka, je lahko kriv drug pogoj. Bolniki morajo poiskati nasvet zdravnika, če se neželeni učinki podaljšajo, se ne spremenijo niti med zdravljenjem ali se sčasoma poslabšajo. Obstaja veliko različnih stanj, ki lahko povzročijo simptome, podobne običajnim stranskim učinkom zdravil za ščitnico.
Večino zdravil je treba jemati več tednov, preden začnejo delovati v celoti, zato ne smemo pričakovati takojšnjega prenehanja simptomov. Simptomi bolezni ščitnice se lahko nadaljujejo več dni ali tednov, vendar se morajo sčasoma počasi umiriti ali zmanjšati. Večina bolnikov dokaj dobro prenaša zdravila za ščitnico, nekateri neželeni učinki pa morda ne zahtevajo spremembe odmerka, saj se njihovo telo pogosto prilagaja zdravilu in simptomi izginejo sami. Za zagotovitev pravilnega delovanja ščitnice med zdravljenjem so potrebne rutinske preiskave.