Surovi glicerol ali glicerin je eden od stranskih produktov proizvodnje biodizla. Surovi glicerin zaradi visoke vsebnosti nečistoč ni primeren za večino komercialnih aplikacij in ga je treba pred trženjem dodatno izboljšati. Po prečiščevanju se lahko prečiščeni glicerin uporablja v istih aplikacijah kot konvencionalno proizvedene sorte, vključno s hrano in farmacevtskimi izdelki, kozmetiko in kemičnimi formulacijami. Rafiniranje surovega glicerina pa je drago, ekonomičnost postopka pa je prisilila proizvajalce biodizla, da iščejo komercialno izvedljive uporabe surovega proizvoda, kot so kompostiranje, zgorevanje, živalska krma in eksplozivi.
Porabo glicerina iz biodizla lahko razdelimo v dve kategoriji: rafinirani izdelki, ki izpolnjujejo komercialne standarde čistega glicerina, in izdelki na osnovi nerafiniranega surovega glicerina. Rafiniranje surovega glicerina odstrani metanol, proste maščobne kisline, kalcij, magnezij in žveplo ter zagotavlja minimalne koncentracije glicerola, aktivne sestavine v glicerinu, 80%. Čisti glicerin, rafiniran iz surovih stranskih produktov biodizla, je v bistvu enak tistemu, ki je proizveden na druge načine, in se lahko uporablja v podobnih aplikacijah. Po drugi strani pa se surovi glicerin uporablja kot je ali delno rafiniran.
Rafinirani glicerin iz biodizla se uporablja v številnih panogah, vključno s predelavo hrane, farmacevtsko proizvodnjo in kemično formulacijo. Živilska industrija uporablja glicerin kot sladilo, topilo in gostilo. Uporablja se tudi kot vlažilec za ohranjanje vlažnosti živil in kot polnilo v številnih izdelkih z nizko vsebnostjo maščob. Čisti glicerin iz biodizla je vključen tudi v številna živila z nizkim glikemičnim indeksom (GI), ker ima približno enako kalorično ali energijsko vrednost hrane kot namizni sladkor, vendar ne zvišuje ravni sladkorja v krvi.
Farmacevtska industrija uporablja rafiniran glicerin iz biodizla v številnih izdelkih za medicinsko in osebno nego kot mazivo, vlažilec in sredstvo za izboljšanje teksture. Ti izdelki vključujejo sirupe proti kašlju, ekspektoranse, zobne paste, izdelke za nego kože in kremo za britje. Mila, izdelki za nego las in osebna maziva vsebujejo tudi glicerin kot dodatek. Glicerin se pogosto uporablja tudi kot sredstvo za držanje tablet v formulaciji trdnih odmerkov zdravil.
Kemična industrija ima več aplikacij za prečiščen glicerin iz biodizla. Te aplikacije vključujejo dodatke za gorivo, kot je glicerin acetat, komponenta v površinskih premazih in kot dodatke v umetniških barvah. Glicerin najdemo tudi v formulacijah za proizvodnjo papirja, barvilih, črnilih in sredstvih proti zmrzovanju.
Surov ali delno rafiniran glicerin se uporablja v številnih panogah, ki ne zahtevajo visoke stopnje čistosti. Ti vključujejo proizvodnjo eksploziva, aerobno kompostiranje in vrsto živalskih krmnih proizvodov. Glicerin, pridobljen iz biodizla, je dodan tudi izdelkom za zatiranje prahu in je bil uporabljen kot osnova za pelete za zgorevanje goriva.