Najpogostejše nastavitve strežnika proxy so za neposredne povezave z internetom, samodejno zaznavanje in ročno konfiguracijo. Izberete lahko tudi strežnike proxyjev za protokol za prenos hiperteksta (HTTP) in SOCKS, omrežni proxy protokol. Dodatne nastavitve vključujejo brisanje predpomnilnika in varno vezavo.
Nastavitev neposredne povezave se uporablja, ko želi uporabnik neposredno dostopati do interneta, čeprav je brskalnik konfiguriran za uporabo proxyja. Je ena najpreprostejših in najpogostejših nastavitev proxy strežnika in je priročna funkcija, ko mora uporabnik preklopiti med svojim resničnim naslovom IP in proxyjem. Ko je ta nastavitev uporabljena, se proxy zaobide.
Nastavitve proxy strežnika je mogoče zaznati tudi samodejno. Ko morajo omrežni računalniki uporabljati enake nastavitve proxyja, je mogoče nastaviti strežnik in ustvariti poseben profil z datotekami .ins in .cab. To je hiter in preprost način za nadzor nastavitev proxyja z enega osrednjega mesta, saj računalniki samodejno zaznajo pravilne nastavitve.
Ročna konfiguracija omogoča uporabnikom, da ročno vnesejo nastavitve proxy strežnika. Do te funkcije lahko običajno dostopate prek menija »Orodja« v spletnem brskalniku. Plošča z nastavitvami bo ponudila možnost brez proxyja, samodejno zaznavanje, nastavitve sistemskega proxyja in ročno konfiguracijo. Če je izbrana ročna konfiguracija, bo uporabnik lahko izbral vrsto proxyja, ki ga bo uporabljal. Nato lahko vnesete pravilne podatke za dokončanje konfiguracije.
Uporabniki bodo pogosto imeli možnost izbire med proxy strežniki HTTP ali proxyji SOCKS, zlasti če se uporablja programska oprema proxy strežnika. Uporabnik vnese naslov in vrata proxyja. Če gre za varen proxy, bo programska oprema uporabnika pozvala, da vnese tudi uporabniško ime in geslo.
Brisanje predpomnilnika je še ena nastavitev proxy strežnika. Varuje uporabniške podatke v primeru shranjenih gesel. Nekateri programski paketi proxy strežnika ponujajo tudi možnost brisanja piškotkov in začasnih datotek brskalnika, potem ko uporabnik prekine povezavo s proxyjem.
Nekateri programski paketi proxy ponujajo tudi nastavitev varne vezave. Ko je to omogočeno, je uporabnik zaščiten, tudi če proxy strežnik ne uspe. Ta nastavitev prekine internetno povezavo, če proxy preneha delovati med uporabo, kar preprečuje razkritje uporabnikovega resničnega naslova IP. To je priročna funkcija, ko uporabljate varna spletna mesta ali kadar je “puščanje” naslova IP zaskrbljujoče.