Koristne bakterije, znane tudi kot probiotiki, lahko pomagajo pri zdravljenju nekaterih okužb, kot so okužbe sečil ali glivične okužbe pri ženskah. Bakterije se lahko uporabljajo tudi za zdravljenje prebavil. Te bakterije lahko na primer pomagajo ljudem s sindromom razdražljivega črevesja. Druge medicinske uporabe probiotikov vključujejo zdravljenje ekcemov, skrajšanje trajanja gripe ali prehlada in pomoč pri zmanjševanju ponovitve nekaterih vrst raka.
Jemanje koristnih bakterij v obliki dodatkov ali uživanje jogurta, ki vsebuje bakterije, lahko pomaga pri zdravljenju ali preprečevanju vaginalnih glivičnih okužb pri ženskah. Bakterije pomagajo znižati pH vaginalnega območja in ustvarjajo okolje, ki je negostoljubno za Candido albicans, kvasovko, ki običajno povzroča okužbe.
Uživanje ene 6- do 8-unčne posode jogurta na dan običajno pomaga preprečiti okužbe ali pomaga odpraviti trenutne okužbe. Za najboljše rezultate naj bo jogurt nesladkan ali umetno sladkan. Ženske, ki ne jedo jogurta, bodo morda želele jemati probiotični dodatek, ki vsebuje bakterijo Lactobacillus acidophilus.
Koristne bakterije se lahko uporabljajo tudi za pomoč bolnikom, ki imajo sindrom razdražljivega črevesja (IBS), gastrointestinalno motnjo, ki se pojavi v debelem črevesu in pogosto povzroča želodčne krče, drisko in pline. Nekdo z IBS morda ne proizvaja dovolj koristnih bakterij v debelem črevesu, zato lahko dopolnjevanje z jogurtom, ki vsebuje probiotike, ali s kapsulo pomaga zmanjšati simptome. Dodatek probiotikov lahko pomaga tudi pri lajšanju in lajšanju simptomov, ki jih oseba doživlja.
Probiotiki lahko pomagajo obnoviti ravnovesje bakterij v človekovem sistemu po zdravljenju z antibiotiki. Antibiotiki na splošno ubijejo vse bakterije, škodljive in zdrave, zaradi česar je človekov sistem v neravnovesju. Bakterije lahko pomagajo pri zdravljenju driske, ki jo povzročajo antibiotiki, saj obnavlja dobre bakterije v črevesnem traktu.
Druge medicinske uporabe koristnih bakterij vključujejo njihovo uporabo za krepitev imunskega sistema in skrajšanje trajanja pogostih bolezni, kot sta prehlad ali gripa. Bakterije bodisi tekmujejo z virusi ali bakterijami, ki napadajo, ali pa izboljšujejo delovanje imunskega odziva in tako pomagajo osebi hitreje okrevati. Bakterije lahko preprečijo tudi atopični dermatitis pri otrocih.
Bakterije lahko pomagajo tudi pri težavah z mehurjem in sečili. Lahko zmanjša tveganje za nastanek raka na mehurju in skrajša trajanje okužbe sečil. Dnevna porcija jogurta ali probiotični dodatek lahko pomaga zmanjšati tveganje za težave z mehurjem.