Medtem ko mnogi mislijo na odvzem prstnih odtisov kot na dejavnost, ki poteka pri rezervaciji posameznikov za določena kazniva dejanja, je dejstvo, da ima ta pristop k identifikaciji več drugih pomembnih funkcij. Nekateri od teh procesov so povezani z zaščito otrok. Tukaj je nekaj prednosti, povezanih z otroki z odvzemom prstnih odtisov, tako v smislu vsakodnevnih dejavnosti kot kot sredstva za identifikacijo v izrednih razmerah.
Številne skupnosti zdaj podpirajo zamisel o odvzemu prstnih odtisov otrok kot načinu za ohranjanje zanesljivih identifikacijskih podatkov, ki jih je mogoče uporabiti v primeru, da je otrok pogrešan. Poleg skeniranja oči lahko prstni odtisi olajšajo ugotavljanje identitete otroka, ki je bil ugrabljen in pozneje pobegnil pred ugrabitvijo. Kot del kompleta za prstne odtise se staršem ali skrbnikom zagotovijo kartice, ki vsebujejo kopijo odtisov. Komplete teh osebnih izkaznic prstnih odtisov lahko hranite doma, pa tudi v šolski evidenci otroka. Elektronske kopije se lahko hranijo tudi pri organih pregona prek nacionalnih zbirk podatkov, kot je tista, ki jo vzdržuje Zvezni preiskovalni urad v Združenih državah.
Otroci z odvzemom prstnih odtisov so lahko v pomoč tudi v situacijah, ko so skrbniki in otroci ločeni zaradi neke vrste naravne nesreče. Na primer, če poplava uniči skupnost in pusti otroka travmatiziranega do te mere, da postane nekomunikativen, lahko oblasti vzamejo niz prstnih odtisov in jih primerjajo z odtisi, zabeleženimi v nacionalni zbirki podatkov. To olajša določitev identitete otroka in začetek postopka iskanja in stika s sorodniki, ki so verjetno podivjani od skrbi glede pogrešanega otroka.
Na podoben način je otrokom lahko zelo koristno jemanje prstnih odtisov, ko so starši in otroci ločeni na potovanju, na primer na počitnicah. Starši lahko lokalnim oblastem zagotovijo kopijo odtisov skupaj s fizičnim opisom otroka, kar lahko pomaga pri iskanju. Ko je izgubljenega otroka identificiran, ga lahko hitro vrnejo staršem in tako končajo tisto, kar mnogi starši menijo za svojo najhujšo nočno moro.
Vsi se ne strinjajo s konceptom otroških prstnih odtisov. Zagovorniki včasih na proces gledajo kot na poseg v zasebnost, ki ima vseživljenjske posledice. Hkrati zagovorniki opozarjajo na potencialne nevarne situacije, ki jih najdemo v številnih mestih in krajih, zaradi katerih je ideja o jemanju prstnih odtisov praktična in pomembna za proces varovanja otrok. Ker je koncept otroških prstnih odtisov pogost v več jurisdikcijah po vsem svetu, se bo brez dvoma še naprej razpravljalo o prednostih in slabostih tega pristopa k varnosti otrok.