Prednosti in slabosti uporabe morfija so odvisne od tega, kako se uporablja. V nadzorovani zdravstveni situaciji, kjer dolgotrajna zloraba ni verjetna ali možna, je mogoče odpraviti nekatere negativne lastnosti, kot sta odvisnost in tveganje prevelikega odmerjanja. Še vedno pa obstajajo drugi negativni učinki morfija. Pozitivno je, da je lajšanje bolečin, ko je morfij predpisan iz zdravstvenih razlogov, nujno, morfij pa je na tem področju zelo učinkovit. Čeprav je dobro neodvisno pretehtati prednosti in slabosti uporabe morfija, je zelo malo zdravstvenih situacij, v katerih bi bolnik morda želel zavrniti uporabo morfija, če mu je ta predpisan.
Med pozitivnimi učinki uporabe morfija je najpomembnejše lajšanje bolečin. Morfin je zelo dober pri lajšanju hude bolečine in čeprav obstajajo druga zdravila, ki bi lahko naredila isto, imajo zdravniki običajno dober razlog za predpisovanje morfija in ne drugega nadomestka. Natančni razlogi se od primera do primera razlikujejo. Obstajajo številne druge uporabe morfija, ki so lahko vse pozitivne lastnosti, odvisno od primera.
Negativno je, da obstajajo številne lastnosti, zaradi katerih je uporaba morfija neprijeten ali celo nevaren. Znano je, da morfij povzroča močno odvisnost, kar je lahko problematično, če je uporaba nenadzorovana. Ljudje tudi razmeroma hitro razvijejo toleranco do morfija, kar vodi do še večje uporabe morfija. O teh premislekih se je treba pogovoriti z zdravnikom, če jemljete morfij v daljšem časovnem obdobju ali zunaj bolnišnice.
Bolj neposredni negativni učinki morfija vključujejo zaprtje, glavobole in slabost. Nekateri ljudje doživljajo tesnobo, drugi pa evforijo. Skoraj v vsaki situaciji, ko je morfij predpisan proti bolečinam, bodo ti stranski učinki bistveno bolj znosni kot sama bolečina. Če je morfij priporočljiv za druge namene, so lahko stranski učinki izrazitejši in nesprejemljivi.
Uporaba morfija se šteje za negativno iz razlogov, ki skoraj niso povezani z medicino, vendar ta povezava postavlja pod sum medicinsko uporabo morfija. Mnogi ljudje, ki jim je predpisan morfij iz zdravstvenih razlogov, zlasti tistih, ki se nanašajo na bolečino, nikoli ne razvijejo psiholoških simptomov odvisnosti, čeprav razvijejo fiziološko odvisnost. Zaradi razmerja med morfinom in heroinom mnogi ljudje sumijo, da ne bodo mogli ravnati z morfinom, tudi če jih nadzoruje zdravstveni delavec. Pomembno je vedeti, da sta uporaba droge v medicini in zloraba drog zelo različni in način, kako bi lahko nekdo določil, ali naj drogo jemlje rekreativno, ne velja v medicinskem kontekstu.