Terapija z negativnimi ioni lahko olajša sezonsko afektivno motnjo in ima protimikrobne učinke, proizvaja pa tudi vonj po ozonu in ima omejene emisije. Mnogi ljudje pripisujejo učinke negativne zračne ionizacijske terapije z zagotavljanjem lajšanja številnih fizičnih simptomov in izboljšanjem splošnega zdravja, in je zelo priljubljena na Japonskem in v Evropi. Omejene študije kažejo, da lahko generatorji negativnih ionov dejansko spremenijo kakovost zraka, vendar možne zdravstvene koristi vplivajo le na nekatere ljudi.
Raziskovalci so odkrili, da kaskadni slapovi in trkajoči valovi zagotavljajo več kot le estetski učinek. Ko molekule vode trčijo, pride do kemične reakcije, ki sprošča negativno nabite ione v zrak, kar povzroči pomirjujoč učinek. Nekateri zdravniki verjamejo, da običajna gospodinjska prha naredi enako in povzroči enako reakcijo. Ko so psihologi osebe, ki trpijo za sezonsko čustveno motnjo ali blago depresijo, izpostavili sobi, napolnjeni z negativnimi ioni, so mnogi doživeli olajšanje. Študije kažejo, da ta terapija zmanjša raven serotonina, nevrotransmiterja, ki pri nekaterih povzroči hiperrazdražljivost, kar obrne učinek melanholije.
Zdravljenje z negativnimi ioni, ki je kategorizirano kot alternativna medicina, lahko nekatere uporabnike osvobodi zdravil na recept in njihove široke palete stranskih učinkov. Nekatere študije tudi trdijo, da negativno napolnjene sobe odpravljajo bakterije in viruse v zraku s proizvodnjo vodikovega peroksida, ki ubija anaerobne mikrobe. Kmetijski testi poročajo o zmanjšanju prašnih delcev v zraku v okoljih živine, saj se negativni ioni verjetno zlepijo z delci, kar poveča njihovo težo in povzroči, da onesnaževala izstopajo iz zraka. Ta reakcija naj bi koristila tudi nekaterim alergikom, saj zmanjša simptome, ki jih povzročajo dihalni antigeni, in tako olajša alergijo.
Idealno negativno nabito zunanje okolje običajno vsebuje 5,000 ali več negativnih ionov na kubični centimeter. Da bi bila tako učinkovita, mora ionska terapija v zaprtih prostorih ustvariti podobne ravni. Sistemi za ogrevanje in klimatizacijo ter elektronske naprave običajno oddajajo pozitivno nabite ione, generatorji za terapijo z negativnimi ionami pa morajo imeti stalen zračni tok, ki poteka čez napravo ali indukcijske ventilatorje, ki krožijo negativno nabit zrak, da jim preprečijo in napolnijo prostor z negativnimi ioni. Številne naprave niso opremljene z ventilatorji, proizvajalci pa predlagajo, da so prednosti na voljo le ljudem v neposredni bližini generatorja.
Druga pomanjkljivost terapije z negativnimi ioni je vonj, podoben tistemu v velikem mestu, onesnaženem z industrijskimi emisijami. Prekomerno število negativnih ionov proizvaja O3 ali ozon pri visoki vlažnosti. Ne samo, da se nabiti in težki delci ne morejo zadrževati v zraku, ampak jih privlači katera koli pozitivno nabita površina, kar lahko povzroči višje ravni vidnega prahu in umazanije. Nekateri izvajalci zdravstvenih storitev trdijo tudi, da lahko le tretjina prebivalstva dejansko opazi učinke negativnih ionov.