Voda v bazenu mora biti bistra in brez močnih vonjav, ploščice pa morajo biti čiste in gladke, brez sluzi ali razbarvanja. Za ohranjanje čistih in zdravih nadzemnih in podzemnih bazenov je potrebno redno vzdrževanje. Patogene, ki povzročajo bolezen, je treba odstraniti ali uničiti, preprečiti pa je treba alge, da ostane voda čista. Za varno uporabo bazena je potrebno vzdrževati optimalno raven pH in klora.
Optimalne ravni klora za večino temperatur vode so med 1 in 3 deli na milijon (ppm). V idealnem primeru mora biti v bazenu vedno okoli 2 ppm, vodo pa je treba redno testirati. Ravni klora v bazenu vključujejo prosti klor, ki aktivno čisti bazen, in kombinirani klor ali kloramine, ki nastane, ko se klor veže z onesnaževalci in postane neaktiven.
Raven klora v bazenih se običajno vzdržuje na dva načina. Prvič, nekje blizu filtra je tableta klora s počasnim sproščanjem ali klorova palica, ki porazdeli klor po vodi. Različne znamke klora s počasnim sproščanjem trajajo različno dolgo, zato natančno preberite navodila. Ker se klor veže z onesnaževalci, postane neaktiven. Zato je treba vodo v bazenu vsak teden ali dva »šokirati« z dodajanjem električnega ali tekočega klora neposredno v vodo. Šok obdelava sežge uporabljeni klor, ki ga nato odstrani filter.
Ko v bazenu močno diši po kloru ali opeče oči ali kožo, mnogi verjamejo, da je to posledica visoke ravni klora, vendar to na splošno ni tako. Močan vonj po kloru povzroča presežek kloraminov v bazenu. Kloramini so spojine, ki nastanejo, ko se klor združi z amoniakom v kontaminantih. Je neaktiven klor in ga je treba odstraniti s šokiranjem bazena z aktivnim klorom.
Če voda v bazenu povzroči pekoč občutek ali kožo ali pordelost oči, je vzrok pogosto previsok ali nizek pH. V idealnem primeru bi moral biti pH bazena med 7.2 in 7.6. Če je pH prenizek, lahko poškoduje opremo za ogrevanje in filtriranje ter obarva stene. Če je pH previsok, lahko klor postane neučinkovit ali neaktiven. PH je mogoče znižati s kislino in dvigniti s sodo, čeprav bi morali lastniki bazenov raziskati druge razloge za spremembe pH, preden ga poskušajo prilagoditi.