Učinki prostaglandinov na gladke mišice omogočajo uporabo hormona za zdravljenje glavkoma in nekaterih ishemičnih motenj. Prostaglandini, ki so sestavljeni iz nenasičenih maščobnih kislin, uravnavajo pretok ionov na celični ravni in se lahko uporabljajo kot sredstvo za indukcijo poroda. Nesteroidna protivnetna zdravila (NSAID) običajno delujejo kot antagonisti prostaglandinov za zmanjšanje vročine, vnetja in bolečine. Ta dejanja pogosto povzročajo tudi gastrointestinalne motnje. Sočasna uporaba prostaglandinov z nesteroidnimi protivnetnimi zdravili zmanjša možne neželene učinke na želodcu.
Travaprost spada v skupino zdravil, znanih kot analogi prostaglandina, ki posnemajo učinke lipidnih spojin. Zdravilo je na splošno predpisano za preprečevanje intraokularnega tlaka, ki je običajno povezan z glavkomom odprtega zakotja. Analogi prostaglandina v formulaciji učinkovito povečajo uveoskleralni odtok in znižujejo pritisk. Pri intravenski uporabi imajo posamezniki z ishemičnimi motnjami, ki vključujejo Reynaudov sindrom, manj in manj pogoste napade. Vazodilatacijski učinki, ki jih povzroča sprostitev gladkih mišic prostaglandinov, povečajo pretok krvi in zmanjšajo simptome, povezane z ishemijo.
Zdravniki lahko uporabljajo PGE1 ali alprostadil za vzdrževanje odprtine arterioze duktusa pri dojenčkih z diagnozo teh srčnih bolezni do kirurškega posega. Duktus na splošno omogoča pretok krvi iz pljučne arterije, da obide pljuča in potuje nazaj v aorto pri nerojenih dojenčkih. Ta ventil se običajno zapre kmalu po rojstvu, vendar lahko povzroči stres pri dojenčkih, ki trpijo za srčnimi ali pljučnimi anomalijami. Ohranjanje te odprtine zmanjša obremenitev srca in zaobide okvarjene žile.
Moški, ki imajo erektilno disfunkcijo, lahko prejmejo tudi recept za zdravilo Alprostadil. Ker zdravilo običajno sprošča gladke mišice arterij, se poveča pretok krvi v penis. Z zadostnim ali povečanim pretokom krvi moški običajno dosežejo erekcijo. Zdravilo se lahko injicira neposredno v kavernozo penisa ali vstavi v obliki pelet v odprtino sečnice.
Zdravilo dinoproston, ki se daje vaginalno v obliki gela ali supozitorijev, običajno povzroči porod. Prostaglandinski hormoni, znani kot PGE2, sprostijo gladka mišična vlakna maternice, ki dozori maternični vrat, tako da povzroči razširitev in redčenje. Pripravek običajno sproži tudi krčenje maternice. Porodničarji lahko uporabljajo tudi PGE2 po porodu za vzdrževanje tonusa maternice. Ko maternica izgubi tonus ali sposobnost pravilnega krčenja, se pretok krvi poveča, kar lahko povzroči krvavitev.
NSAID na splošno zavirajo učinke prostaglandinov. Nekateri od teh učinkov običajno ščitijo občutljivo sluznico prebavil. Minus teh zaščitnih lastnosti se lahko pojavi razjeda. Mizoprostol je analog prostaglandina, ki poveča proizvodnjo bikarbonata in sluzi. Povečana zaščita sluznice zmanjša verjetnost notranjih poškodb zaradi nesteroidnih protivnetnih zdravil.