Kontraindikacije za antibiotike se nanašajo na okoliščine, v katerih se ta zdravila ne smejo uporabljati, ker so lahko neučinkovita ali nevarna. Skupina zdravil pod tem okriljem se nenehno povečuje in vsako zdravilo v tej družini ima posebne kontraindikacije, ki jih je treba upoštevati pred jemanjem. Pred jemanjem teh ali drugih zdravil je anamneza za zbiranje informacij o preteklih zdravstvenih težavah, trenutnih zdravilih, ki se uporabljajo, in simptomih pomembno orodje za zagotovitev, da bolniki dobijo pravi antibiotik. Na splošno lahko nekatere kontraindikacije za antibiotike vključujejo naravo okužbe, bolnikovo starost, obstoječa zdravstvena stanja in anamnezo.
Nekateri primeri antibiotikov vključujejo kinolone, cefalosporine, sulfonamide in peniciline. Ta zdravila so lahko učinkovita proti glivam, bakterijam in parazitom. Njihov razpon učinkovitosti je odvisen od vrste zdravila, saj nobeno zdravilo ne more delovati proti vsem organizmom. Virusna okužba je ena od kontraindikacij za antibiotike, saj zdravila ne bodo uničila virusov ali pacientu ponudila drugih koristi.
Eden od premislekov pri priporočanju antibiotikov je poznavanje vzroka okužbe. Če je na voljo kultura s posebnimi informacijami o organizmu, lahko to zoži možnosti zdravljenja. V primerih, ko podrobnosti niso znane, je najboljša možnost antibiotik širokega spektra, za katerega je znano, da deluje proti okužbam te vrste. Drugo vprašanje je lahko raven odpornosti vpletenih organizmov ali tveganje odpornosti glede na vrsto okužbe. Neučinkovitih zdravil se ne sme uporabljati in morda bo treba opraviti kulturo, da bi našli zdravilo, ki bo delovalo.
Starost je včasih lahko kontraindikacija za antibiotike. Mladi bolniki so lahko bolj izpostavljeni negativnim reakcijam na zdravila, v drugih primerih pa ni na voljo dovolj podatkov o varnosti pri otrocih. Če je mogoče, se lahko uporabi ozek nabor zdravil, za katera je znano, da so varna. Če ima bolnik resno okužbo, se lahko priporoči bolj agresivno zdravilo. Tudi nosečnice so lahko izpostavljene tveganju zapletov pri nekaterih zdravilih.
Obstoječa zdravstvena stanja in anamneza bolnika so lahko pomembne kontraindikacije za antibiotike. Ljudje z boleznijo jeter ali ledvic morda ne bodo mogli jemati nekaterih zdravil. V drugih primerih so lahko antibiotiki vključeni v interakcije zdravil, ki povzročajo slabe reakcije. Zgodovina alergij na določena zdravila je še ena močna kontraindikacija, saj lahko bolnik ob drugi izpostavljenosti doživi hud alergijski odziv. Zdravila v istem razredu so lahko zaradi varnosti tudi izključena iz možnosti za bolnika.