Obstaja veliko funkcij srednjih možganov, vključno z regulacijo telesne temperature, nadzorom motorja in cikli spanja. Poleg tega vmesni možgani vplivajo na sluh, vid in vzburjenje. Ta vitalna regija je odgovorna za nadzor vseh odzivov, povezanih s senzoričnimi informacijami, in uravnavanje delovanja telesa na te odzive. Na primer, če roka doživi ostro bolečino, srednji možgani povedo možganom, da se mora roka potegniti nazaj.
Območje srednjih možganov je del osrednjega živčnega sistema. Nahaja se blizu središča možganov, pod možgansko skorjo in na vrhu zadnje možganske regije. Ta regija združuje hrbtenjačo in možgane skupaj in se običajno imenuje del možganskega debla predvsem zaradi svoje lokacije.
Funkcije srednjih možganov se izvajajo prek možganske skorje, malih možganov in črne snovi. Vhodni podatki se zbirajo iz okolja in pošiljajo v možgansko skorjo. Substantia nigra uporablja vnos, ki ga pošilja možganska skorja, za uravnavanje prostovoljnih gibov in razpoloženja. Pot, imenovana rubrospinalni trakt, poteka od malih možganov do spodnjih motoričnih središč možganov in pošilja vhod kot pot za signale prostovoljnega gibanja.
Zaradi funkcij srednjih možganov ga uvrščamo med najbolj napredne regije možganov. Sam srednji možgani, znan tudi kot mezencefalon, je razdeljen na pododdelke. Tectum, ki tvori hrbtni pokrov srednjih možganov, uravnava slušne in vidne dražljaje in odzive. Spodnji del, imenovan tegmentum, upravlja motorični nadzor, zavedanje in avtonomne odzive. Drug del, ki je tudi del bazalnih ganglijev, je črna snov, ki nadzoruje in uravnava proizvodnjo dopamina ter vnos in izhod bazalnih ganglijev.
Obstajajo štirje deli tectuma, znani kot corpora quadrigemina. Te delitve se imenujejo kolikuli in so glavni deli, ki nadzorujejo senzorične informacije. Dva spodnja kolikula obdelujeta slušne informacije in se nahajata pod zgornjimi kolikuli. Dva zgornja kolikula obdelujeta vizualne informacije in ju lahko najdete pod talamusom. Ti štirje deli skupaj zagotavljajo skupne funkcije srednjih možganov.
Tegmentum, ki se razteza od možganskega akvadukta do črne substance, vsebuje ključni del, imenovan rdeče jedro. Ta poseben del uravnava koordinacijo gibov, tako preprostih kot zapletenih. Okulomotorični živec, ki je prisoten na tem področju, je odgovoren za gibanje oči in zoženje zenic.