Obstajata dve glavni nevarnosti, povezani s seksom brez kondoma. Ko gre za seks med moškim in žensko, je nosečnost zelo realna možnost. V vseh primerih seks brez kondoma poveča tveganje za okužbo s spolno prenosljivimi boleznimi (STD). Kondomi ne nudijo popolne zaščite pred okužbo s spolno prenosljivimi boleznimi, vendar se zaščita, ki jo nudijo, giblje od dobre do odlične, odvisno od zadevne bolezni. Tveganje za okužbo s spolno prenosljivimi boleznimi je vedno večje pri seksu brez kondoma.
Kondomi so v prvi vrsti oblika kontracepcije in seks brez kondoma ali druge oblike kontracepcije lahko pogosto vodi do nosečnosti. Ko se kondomi iz lateksa uporabljajo pravilno in dosledno, so zelo učinkoviti pri preprečevanju zanositve. Tipičen zdrav par, ki se dokaj redno ukvarja s spolnimi odnosi, ima v povprečju 20-odstotno možnost zanositve vsak mesec, kar ima za posledico skoraj 100-odstotno možnost zanositve v celem letu. Če par pravilno in dosledno uporablja kondome, je možnost zanositve 2 % do 3 %, kar je zelo pomembno zmanjšanje.
Drugo veliko tveganje pri seksu brez kondoma je možnost okužbe s spolno prenosljivimi boleznimi. S spolnim stikom se lahko prenaša več kot ducat različnih okužb. Uporaba kondoma pomaga pri preprečevanju vseh vrst spolno prenosljivih bolezni, vendar je najbolj učinkovita pri preprečevanju širjenja virusa HIV/AIDS. HIV je zelo krhek virus in se običajno širi le, ko telesna tekočina, ki vsebuje virus, vstopi v novega gostitelja, na splošno prek poškodb kože ali stika s sluznicami. Pravilna uporaba kondoma je zelo učinkovita pri preprečevanju te vrste prenosa.
Druge vrste spolno prenosljivih bolezni so bolj robustne kot HIV/AIDS in lahko lažje okužijo nove gostitelje. Virus herpes simpleksa lahko okuži novega gostitelja preprosto s stikom s kožo, prav tako virus, ki povzroča genitalne bradavice. Seks brez kondoma poveča verjetnost prenosa tovrstnih okužb, ker je več kože izpostavljeno, kar povečuje verjetnost prenosa okužbe. Vendar uporaba kondoma ni povsem učinkovita pri preprečevanju prenosa te vrste spolno prenosljivih bolezni.
Moški kondomi so na splošno učinkovitejši pri preprečevanju širjenja spolno prenosljivih bolezni, saj nudijo boljšo oviro pred prenosom telesnih tekočin in okužb kot ženski kondomi. Ženski kondomi pa so zelo učinkoviti pri preprečevanju nosečnosti. Obe vrsti kondoma se lahko zlomita, najpogosteje ob nepravilni uporabi, vendar je to tveganje majhno, tveganja, povezana s seksom brez kondoma, pa so veliko večja in resnejša.