Kajenje med dojenjem lahko povzroči, da imajo matere manjše zaloge mleka, in obstaja velika verjetnost, da nikotin in vse druge škodljive kemikalije v cigaretah preidejo skozi materino mleko do otroka, kar bi lahko povzročilo zdravstvene težave. Raziskave so tudi pokazale, da lahko kajenje med dojenjem prispeva k kolikam in slabim spanjem pri dojenčkih. Ženske, ki kadijo med dojenjem, svoje dojenčke dodatno izpostavljajo pasivnemu kajenju, kar lahko na koncu povzroči težave, kot so astma in pogostejša vnetja ušes. Znanstveniki ne razumejo popolnoma vseh tveganj, povezanih s kajenjem in dojenjem, vendar se večina strinja, da ženske, ki kadijo, ne bi smele prenehati dojiti, ker bi zdravstvene koristi dojenja lahko prevladale nad tveganji kajenja.
Za ženske, ki kadijo, je značilno, da imajo manj mleka kot ženske, ki ne kadijo. Zaradi manjše količine mleka doječe matere, ki kadijo, morda ne dojijo svojih otrok tako dolgo kot matere, ki ne kadijo, ker pomanjkanje mleka običajno povzroči težave z dojenjem. Obstaja tudi nekaj skrbi glede vseh kemikalij v cigaretah, poleg nikotina, ki prehaja skozi materino mleko. Preden bodo ti učinki popolnoma razumljeni, je potrebnih več raziskav, vendar imajo znanstveniki razlog za domnevo, da bi zdravstvene koristi materinega mleka lahko izničile učinke cigaretnih kemikalij, ko te preidejo na otroka.
Raziskave so pokazale, da dojenčki mater, ki med dojenjem kadijo, pogosteje razvijejo kolike kot dojenčki mater, ki ne kadijo. Kolike so dokaj pogosta težava, ki prizadene veliko dojenčkov, starih od enega do šestih mesecev. Ko imajo dojenčki kolike, običajno nenadzorovano jokajo in se obnašajo, kot da jih boli ure in ure ob različnih časih čez dan. Zdravniki ne vedo, kaj povzroča, in običajno izgine v nekaj mesecih po začetku.
Morda obstaja tudi neka povezava med kajenjem med dojenjem in navadami spanja. Otroci mater, ki kadijo in dojijo, običajno ne spijo tako dobro kot dojenčki mater, ki ne kadijo. Dojenčki, ki so izpostavljeni cigaretam skozi materino mleko, pogosteje jokajo in se pogosteje zbujajo čez dan, ko dremajo in tudi med spanjem ponoči. Raziskave kažejo, da so pretirana vznemirjenost in slabe spalne navade dojenčkov, rojenih materam, ki dojijo, lahko posledica izpostavljenosti cigaretam.
Možno je, da obstaja več razlogov za zaskrbljenost zaradi učinkov pasivnega kajenja na otroka kot možnih negativnih učinkov nikotina in drugih kemikalij, ki prehajajo v materino mleko. Pasivno kajenje lahko povzroči vse vrste težav, ne le, ko so otroci dojenčki, ampak tudi, ko se starajo. Dojenčki, ki so izpostavljeni pasivnemu kajenju, imajo večjo verjetnost, da bodo imeli v otroštvu težave z dihali, kot so astma in pogosti napadi bronhitisa. Vnetja ušes so pogostejša tudi pri otrocih, ki so bili izpostavljeni dimu kot dojenčki.
Ženske, ki dojijo in kadijo, bi koristile sebi in svojim otrokom, če bi si prizadevale za prenehanje kajenja. Doječim materam, ki kadijo, zdravniki običajno ne odsvetujejo prenehanja dojenja zaradi vseh prednosti materinega mleka. Namesto da bi med kajenjem prenehale dojiti, bi morale matere za vedno opustiti kajenje.