Začetno zdravljenje sfenoidnega sinusitisa je običajno tečaj antibiotikov. Včasih so predpisana tudi zdravila proti bolečinam in dekongestivi, ker lahko zmanjšajo nelagodje, povezano s stanjem. Alternativni načini zdravljenja, kot je vdihavanje s paro, lahko prav tako olajšajo zastoje. Če zdravljenje ne reši stanja v razumnem časovnem okviru, je pogosto potrebna operacija. Cilj operacije za sinusitis je povečati drenažo z izdelavo majhne luknje v sinusu.
Zgodnja diagnoza in zdravljenje sfenoidnega sinusitisa sta pomembna, ker se lahko akutna oblika stanja hitro poslabša. Simptomi so, vsaj na začetku, relativno majhni, zato je težavo v zgodnjih fazah težko diagnosticirati. Ko zdravnik ugotovi stanje, je zdravljenje konzervativno, operacija pa je potrebna le, če druga zdravljenja v ustreznem časovnem okviru ne pomagajo.
Prvo zdravljenje te vrste sinusitisa je pogosto antibiotik. Zdravnik običajno predpiše antibiotike, ki vplivajo na vrsto bakterij, ker to poveča možnost za uspešno zdravljenje. Ker se akutna oblika stanja lahko hitro poslabša, se lahko antibiotiki dajo le kratek čas, da začnejo učinkovati, preden so potrebna druga zdravljenja. Kronični sinusitis se pogosto zdravi z daljšim režimom zdravil, ker to zagotavlja več časa za zdravljenje bakterij v sinusih.
Druga zdravila za zdravljenje sfenoidnega sinusitisa vključujejo dekongestive in vdihavanje pare. Ta zdravljenja lahko olajšajo zastoje, ki je pogost simptom stanja. Za zmanjšanje neugodja se včasih jemljejo zdravila proti bolečinam, medtem ko potekajo druga zdravljenja. V nekaterih primerih se lahko predpišejo tudi antihistaminiki.
Če antibiotiki po kratkem času ne prinesejo ustreznega izboljšanja, bo morda potrebna operacija akutnega sinusitisa. Bolniki, ki kažejo znake poslabšanja ali zaplete, bodo morda potrebovali nujni kirurški poseg. Vedno obstaja tveganje, povezano s kakršno koli operacijo, zato se pogosto najprej poskusi z manj invazivnim zdravljenjem.
Kirurgija za sfenoidni sinusitis vključuje povečanje drenaže v sinusu. To dosežemo z izdelavo majhne luknje. Vrsta izvedene operacije je odvisna od številnih dejavnikov, vendar je etmoidektomija pogosta. To se običajno izvaja ambulantno, kar pomeni, da bolniku ni treba ostati čez noč v bolnišnici. Operacija se običajno izvaja v splošni anesteziji in vključuje prehajanje majhne cevke s kamero v nos.