Vrste zdravljenja psevdomembranoznega kolitisa vključujejo operacijo in jemanje probiotikov ali antibiotika, učinkovitega proti bakterijam, ki povzročajo okužbo, običajno C. difficile. To stanje običajno povzroči antibiotik, lahko pa je tudi posledica kemoterapije ali katerega koli drugega zdravila, ki poruši ravnovesje bakterij v prebavnem sistemu osebe. To lahko povzroči razmnoževanje škodljivih bakterij, sproščanje toksinov in draženje debelega črevesa. Vsako zdravljenje psevdomembranoznega kolitisa se bo začelo z identifikacijo škodljivega antibiotika, prekinitvijo tega zdravljenja in uvedbo drugega antibiotika, ki cilja na krivo bakterijo. Nekateri bolniki bodo morda potrebovali operacijo, čeprav so ti primeri redki.
Skoraj vsak antibiotik lahko poruši ravnovesje med koristnimi in škodljivimi bakterijami v človekovem prebavnem sistemu. To je zato, ker je antibiotik običajno nediskriminatoren; cilja na vse bakterije v telesu, ne le na škodljive vrste. Če so koristne bakterije oslabljene, se lahko škodljive bakterije, ki so bile nadzorovane, razmnožijo in sproščajo toksine, ki dražijo debelo črevo. Posledično lahko bolnik doživi drisko, trebušne krče in zvišano telesno temperaturo. Kemoterapija in nekatera druga zdravila lahko povzročijo tudi psevdomembranski kolitis.
Ko se to stanje razvije, zdravniki običajno razmislijo o dveh konvencionalnih zdravljenjih psevdomembranoznega kolitisa. Prvi korak je ugotoviti, katera zdravila ali zdravljenje lahko povzročijo draženje in ga, če je mogoče, ustaviti. Tipični osumljenci so antibiotiki, kot so kinoloni, penicilini in cefalosporini. V mnogih primerih je za odpravo simptomov dovolj prekinitev motečega zdravljenja.
Če prenehanje jemanja zdravila ni dovolj, lahko zdravnik predlaga dodatno zdravljenje psevdomembranoznega kolitisa. Naslednji korak je pogosto začetek jemanja antibiotika, ki učinkoviteje cilja na škodljive bakterije v prebavilih. Veliko primerov psevdomembranoznega kolitisa povzroča bakterija C. difficile, zato bo jemanje antibiotika, ki je učinkovit proti njej, omogočilo, da si koristne bakterije opomorejo. Morda se zdi kontraintuitivno zdraviti stanje, ki ga je verjetno povzročil antibiotik, z drugim antibiotikom, vendar je cilj obnoviti ravnovesje med koristnimi in škodljivimi bakterijami v bolnikovem prebavnem traktu.
V nekaterih primerih začetno zdravljenje psevdomembranoznega kolitisa ne bo učinkovito. Simptomi se bodo ponovili v nekaj mesecih. Ti bolniki lahko razmislijo o dodatnem ali dveh antibiotikih ali operaciji. Kirurgija je redka možnost, običajno rezervirana za tiste z dodatnimi zapleti, kot sta odpoved organov ali peritonitis. Kirurško zdravljenje psevdomembranoznega kolitisa je delna kolektomija.
Poleg ali kot alternativa običajnemu zdravljenju psevdomembranoznega kolitisa lahko bolniki razmislijo o jemanju probiotikov. Probiotiki so koncentrirani odmerki koristnih bakterij, ki lahko pomagajo ponovno vzpostaviti ali okrepiti obstoječe kolonije v prebavnem sistemu osebe. Probiotik se običajno jemlje peroralno v obliki kapsul ali tekočine. Probiotiki so naravno na voljo tudi v nekaterih živilih, kot je jogurt.