Najpogostejša tveganja pri hormonskem nadomestnem zdravljenju vključujejo srčni napad in možgansko kap. Ženske, ki prejemajo hormonsko nadomestno zdravljenje (HRT), se prav tako soočajo s povečanim tveganjem za nekatere vrste raka, vključno z rakom dojke. Tveganja nadomestne hormonske terapije vključujejo tudi krvne strdke. Bolezen jeter je lahko še eno tveganje zaradi HNZ.
Ženske v menopavzi lahko doživijo vročine, nihanje razpoloženja ali suhost vagine zaradi zmanjšane proizvodnje hormonov. Kadar druge metode zdravljenja ne dajejo rezultatov, se nekatere ženske odločijo za hormonsko nadomestno zdravljenje. Mnogi zdravniki so pri predpisovanju tega načina zdravljenja previdni, vendar zaradi tveganj pri hormonskem nadomestnem zdravljenju.
Pri ženskah, ki so prejemale hormonsko nadomestno zdravljenje, so poročali o resnih zapletih. Estrogen in progestin se najpogosteje daje ženskam, ki uporabljajo to zdravljenje. Raziskave kažejo povečano tveganje za razvoj bolezni srca ali srčnega infarkta med jemanjem teh hormonov. Številne ženske, ki so sodelovale v študiji iz leta 2002, so med jemanjem teh dodatkov doživele resne neželene učinke.
Poleg povečanega tveganja za raka dojk tveganja pri hormonskem nadomestnem zdravljenju vključujejo tudi večjo incidenco raka maternice. Študije so pokazale, da imajo ženske, ki jemljejo odmerke estrogena, progestina ali obojega, večje tveganje za razvoj raka endometrija. To tveganje postane bistveno večje, če ženske uporabljajo samo estrogen. Povečano tveganje za raka jajčnikov je povezano tudi z uporabo hormonskih dodatkov.
Obstajajo tudi druge, manj hude reakcije, povezane z uporabo hormonskih dodatkov. Drugi stranski učinki so prebavne motnje in zgaga. Druga pogosta tveganja za nadomestno hormonsko terapijo vključujejo slabost in bruhanje. Nekatere ženske so poročale tudi o neželenih učinkih, kot so migrenski glavoboli in vaginalne krvavitve med zdravljenjem s hormonskimi dopolnili.
Kot pogosta tveganja pri hormonskem nadomestnem zdravljenju so poročali tudi o čustvenih motnjah. Vendar pa ti niso tako pogosti kot drugi neželeni učinki. Nekatere motnje vključujejo težave s spanjem, razdražljivost in nihanje razpoloženja. Nekatere ženske so poročale tudi, da so med hormonsko nadomestno terapijo doživljale čudne sanje ali nočne more.
Druga pogosta tveganja pri hormonskem nadomestnem zdravljenju lahko vključujejo akne in manjše draženje kože. Različni neželeni učinki HNZ lahko vključujejo tudi zmanjšan apetit ali nenadno izgubo teže. Povečanje telesne mase je lahko še en stranski učinek HNZ. Zasoplost ali piskanje so lahko tudi neželeni učinki, povezani s HNZ. Drugi neželeni učinki HNZ na dihala lahko vključujejo suh kašelj ali tiščanje v prsih.