Minnesota je ena najsevernejših zveznih držav srednjega zahoda ZDA. Kot 32. zvezna država je bila sprejeta leta 1858. Čeprav je Minnesota sprejela državni pečat leta 1861, do leta 1893 ni bilo državne zastave Minnesote. Zdi se, da je bila spodbuda za ustvarjanje državne zastave prihajajoča svetovna kolumbijska razstava leta 1893, ki je bila ki bo potekala v Chicagu, Illinois, v ZDA. Vse ameriške zvezne države, ki jih je bilo takrat le 44, so bile pozvane, da se na razstavi predstavijo in razstavijo o svoji državi, Minnesota pa se je znašla brez državne zastave.
Zakonodajalec Minnesote je imenoval komisijo, ki je sponzorirala natečaj za oblikovanje zastave, ki je bil odprt za prebivalce države. Zmagovalni prispevek je poslala prebivalka Minneapolisa Amelia Hyde Center, državni pečat pa je uporabil kot osrednji emblem zastave. Hydeova zasnova zastave je vključevala različne barve — modro in belo &mddash; na vsaki strani.
Državni pečat Minnesote prikazuje kmeta, ki orje svoje polje, ki je blizu potoka in majhnega slapa. V bližini je odprto zeleno polje, sonce pa vzhaja na hribih in drevesih v daljavi. Kmetova puška se nasloni na štor za njim. Opazuje, kako Indijanec jaha s sulico in ga gleda. Na traku pečata piše “L’Étoile Du Nord”, kar v francoščini pomeni “Zvezda Severnica”.
V prvi državni zastavi Minnesote so bili okoli pečata trije pomembni zgodovinski datumi: 1819, 1858 in 1893. Leta 1819 je bila ustanovljena Fort Snelling pomembna vojaška postojanka za zaščito novih naseljencev. Leto 1858 označuje sprejem Minnesote v državnost, 1893 pa je leto oblikovanja zastave.
Pečat je ovenčan z belimi mokasinskimi cvetovi na modrem polju. Dva trakova tečeta izpod pečata in uokvirjata ime države. Okoli pečata 19 zvezd v majhnih grozdih tvori pet točk večje zvezde. Največja zvezda na zastavi predstavlja Minnesoto. Zasnovo zastave sta na svilo sešili dve norveški priseljenki, Thomane in Pauline Fjelde, državna zastava Minnesote pa je na razstavi prejela zlato medaljo za vezenje.
Prvotna zasnova centra je doživela nekaj sprememb. Leta 1957 je zakonodajalec spremenil državno zastavo Minnesote v enostransko zastavo, v veliki meri na podlagi proizvodnih in stroškovnih premislekov. Zakonodajalec Južne Dakote je leta 1963 iz skoraj enakih razlogov sprejel podobno odločitev glede dvostranske zastave svoje države. Med spremembami leta 1957 so rožnati in beli cvetovi ženskih copat, ki izvirajo iz Minnesote, nadomestili bele cvetove mokasin na vencu, ki obdaja državni pečat.