Za razliko od drugih simbolov Iowe, kot sta državni pečat in cvet, državna zastava Iowe ni bila označena šele v 20. stoletju. Manj kot 20 let po tem, ko se je Iowa pridružila Uniji, se je začela državljanska vojna ZDA, po kateri so državljani čutili, da je državna zastava vse, kar je potrebno. Zastava je bila zasnovana leta 1917 kot odgovor na prošnje pripadnikov Nacionalne garde po emblemu, ki bi jih predstavljal. Po kratkem obdobju uporabe v ta namen je bil državni generalni zbor leta 1921 uradno sprejet zasnovo kot državno zastavo.
Iowa se je Uniji pridružila kot 29. zvezna država leta 1846. Med letoma 1917 je več skupin zahtevalo zastavo, ki bi predstavljala državo. Vendar so nasprotniki menili, da bi določitev državne zastave Iowe pripomogla k zmanjšanju pomena državne zastave ZDA. Ta občutek je bil še posebej izrazit v letih po državljanski vojni, saj se je narod na novo združil in Iowani niso želeli dati videza, da se ločijo od Unije.
Leta 1917 so se enote nacionalne garde iz Iowe pridružile enotam iz drugih držav, ki so bile v službi ob meji med ZDA in Mehiko. Stražarji so opozorili, da imajo drugi polki državne zastave, ki jih predstavljajo, in izrazili so željo po lastni zastavi. Guverner William L. Harding je zahteval oblikovanje državne zastave Iowe, projekt, ki so ga izvedle hčere ameriške revolucije (DAR). Član DAR in rezident Knoxville, Iowa, Dixie Cornell Gebhardt, je bil odgovoren za končni videz zastave.
Gebhardt je za državno zastavo Iowe izbral tribarvno ozadje z enako velikimi navpičnimi črtami modre, bele in rdeče. Ta barvna shema je bila pomig na francosko ozadje države, ki so jo ZDA pridobile kot del nakupa Louisiane iz Francije. Barve imajo tudi ločene pomene, pri čemer modra pomeni pravičnost, zvestobo in resnico, bela simbolizira čistost, rdeča pa pogum.
Modre in rdeče črte so trdne, brez kakršnega koli vzorca na njih. Beli trak vsebuje orla, nacionalno ptico ZDA, ki v kljunu nosi modre transparente. Na teh transparentih je moto države Iowa: “Naše svoboščine cenimo in naše pravice bomo ohranili.” Gebhardt je s kombiniranjem nacionalnega simbola z državnim motom želel pokazati, da je Iowa del ZDA, ne ločena enota. Zadnja značilnost državne zastave Iowe je ime države z rdečimi velikimi črkami pod orlom.
Potem ko so nacionalni gardisti Iowa uporabili zastavo med prvo svetovno vojno, jo je država uradno sprejela kot državno zastavo Iowe 29. marca 1921. Državni predpisi urejajo pravilno velikost in prikaz zastave, vključno z določbo, da vse šole v državi mora vsak šolski dan izobešati zastavo. Kodeks zastave ZDA določa smernice za prikaz z nacionalno zastavo.