Struktura skeletnih mišic se nekoliko razlikuje od drugih dveh glavnih vrst mišic, srčnih in gladkih mišic. Skeletna mišica ima črtast videz, ki se imenuje tudi progasta mišica zaradi dveh prekrivajočih se beljakovin, ki mišici omogočata hitro krčenje. Podolgovate cilindrične celice, ki jih imenujemo tudi mišična vlakna, sestavljajo tudi strukturo skeletnih mišic. Vsaka celica skeletne mišice vsebuje več sto jeder, v nasprotju z enim jedrom, ki ga najdemo v celicah drugih vrst mišic. Mišična vlakna imajo membrane in filamente, imenovane miofibrile, strukture, ki so še posebej pomembne za njihovo kontraktilno funkcijo.
Tri vrste mišičnega tkiva, vključno s skeletnimi, srčnimi in gladkimi mišicami, sestavljajo človeški mišični sistem. Skeletne mišice so najpogostejša vrsta mišic, saj pokrivajo in zagotavljajo gibanje celotnemu skeletu človeškega telesa. Te imajo dve nadomestni imeni: progaste mišice zaradi njihovega navzkrižno progastega videza in prostovoljne mišice, ker lahko zavestni um nadzoruje njihova dejanja. Mišična vlakna se hitro skrčijo zaradi prisotnosti miofibril ali drobnih filamentov, ki vsebujejo dva prekrivajoča se proteina, imenovana aktin in miozin. Kot vidimo pod mikroskopom, se temni pasovi, ki jih tvori miozin, prekrivajo s svetlimi pasovi, ki jih tvori aktin, kar ima za posledico črtast videz strukture skeletnih mišic.
Krčenje mišic je večinoma omogočeno s kemično reakcijo med miozinom in aktinom, nadzorovano pa z delovanjem kalcijevih ionov in dveh drugih beljakovin, ki delujeta skupaj, imenovanih troponin in tropomiozin. Ko se kalcijevi ioni sprostijo iz sarkoplazmatskega retikuluma skeletnih mišic, se nato združijo s troponinom, pride do kemične reakcije in s tem do krčenja mišic. Sproščanje kalcijevih ionov sproži troponin, da spremeni položaj, kar povzroči, da se tropomiozin odriva, s čimer omogoči miozin, da lahko “doseže” in deluje z aktinom. Ko kalcijevi ioni ostanejo shranjeni v sarkoplazmatskem retikulumu, ne pride do mišične kontrakcije in zato pravimo, da mišica “počiva” ali je v sproščenem stanju.
Strukturo skeletnih mišic sestavljata tudi dva membranska sistema, imenovana plazemska ali celična membrana in sarkoplazmatski retikulum, ki sta oba vključena v proces krčenja. Vsako mišično vlakno je obdano s celično membrano, ki ima cevne podaljške, imenovane prečne tubule. Prenos električnih impulzov, ki aktivirajo krčenje, poteka skozi prečne tubule, ki segajo globoko v mišična vlakna. Medtem sarkoplazmatski retikulum, ki se nahaja znotraj mišičnih vlaken, sprošča kalcij med krčenjem mišic in shranjuje kalcij med sprostitvijo mišic. Nastane značilen vzorec, imenovan triada, ker se sarkoplazmatski retikulum nahaja zelo blizu prečnih tubulov.