Razlika med sintakso in morfologijo je v tem, da se sintaksa ukvarja s strukturo stavkov, morfologija pa s strukturo besed. V vsakem jeziku obstajajo pravila, ki usmerjajo način sestavljanja besed. To so pravila sintakse. Morfologija je študija o tem, kako se besede tvorijo in razumejo v jeziku. Tako sintaksa kot morfologija sta povezani s tem, kako se pomen proizvaja z jezikom.
Sintaksa je koncept, ki ureja strukturo stavkov. Vrstni red, v katerem so besede sestavljene, vpliva na pomen stavka kot celote. Upoštevati je treba pravila sintakse, da je stavek slovnično pravilen in smiseln za govorce jezika. To je tisto, kar narekuje stvari, kot so vrstni red osebka in glagola ter kako se uporabljajo pridevniki in prislovi.
Morfologija je študij morfemov, ki so najmanjša pomenska enota v jeziku. Morfem je lahko ena cela beseda ali predpona ali pripona, za katero se razume, da spremeni pomen besede in zato pridobi sam pomen. Morfologija vključuje koncepta pregiba in izpeljanke, ki omogočata, da se besede naredijo v množini ali da se spremeni čas besede. Študij morfologije poskuša razumeti, kako ljudje uporabljajo in razumejo, kako te besede delujejo, v poskusu razumevanja razlike, ki jo naredi en morfem za več besed in kako se besede med seboj nanašajo.
Sintaksa in morfologija sta pomembni za način, kako ljudje črpajo pomen iz jezika, vendar se razlikujeta po tem, da se sintaksa nanaša na vrstni red in uporabo besed, morfologija pa se nanaša na dele besed, ki ustvarjajo pomen. Na primer, mogoče je ustvariti slovnično pravilen stavek, ki pa za govorca jezika ni smiseln. To je mogoče, ker skladnja ureja le vrstni red stavka in ne, kaj pomenijo besede v njem. Po drugi strani je lahko kombinacija besed smiselna, če se uporablja skupaj, vendar izgubi svoj pomen, če je preurejena na način, ki krši pravila skladnje. Sintaksa in morfologija sta različni, vendar sta odvisni drug od drugega.