Prašičja in sezonska gripa lahko sobivata med sezono gripe, vendar med njima obstajajo številne razlike, od tega, kako se virus širi, do tega, kako dolgo se bo čutil pri tistih, ki se z njim okužijo; obstajajo tudi razlike, kako se imunski sistem nanje odzove. Morda je najpomembnejša razlika v tem, da lahko računamo, da bo sezonska gripa okužila prebivalstvo ob relativno rednem času, vendar ni mogoče vedeti, kdaj, kje ali kako huda bo prašičja gripa.
Lahko računamo, da bo ena vrsta gripe letno obkrožila celotno populacijo. Odvisno od območja se izbruhi sezonske gripe pojavljajo z določeno rednostjo; ta predvidljivost daje posameznikom čas za cepljenje kot preventivni ukrep. Ko je prašičja gripa nenadoma mutirala in preskočila s prašičev na ljudi, so bile zdravstvene organizacije na to večinoma nepripravljene, saj ni bilo mogoče napovedati izbruha.
Ker je sezonska vrsta gripe tako razširjena, je človeško telo lahko razvilo nekatere oblike protiteles za boj proti okužbi. Ta imuniteta ni popolna in posamezniki običajno razvijejo nekaj dni vredne simptome; tisti, ki zbolijo za prašičjo gripo, pa so izpostavljeni virusu, ki še nikoli ni bil v človeški populaciji. Ker gre za novo bolezen, nanjo ni naravnih odpornosti, ljudje pa so izjemno ranljivi za vse simptome.
Simptomi prašičje in sezonske gripe so podobni in vključujejo enake telesne bolečine, zvišano telesno temperaturo, kašelj in vneto grlo. Pri prašičji gripi pa so ti simptomi bolj izčrpavajoči; traja dlje; in lahko pogosteje vključuje gastrointestinalne stiske, kot so slabost, driska in bruhanje. Otroci so bolj nagnjeni k zapletom zaradi obeh vrst gripe, medtem ko so starejši dejansko manj dovzetni za hude primere prašičje gripe.
Razlika je tudi v tem, kje izvirata prašičja in sezonska gripa. Virus, ki povzroča sezonsko gripo, je človeški, kar pomeni, da kroži predvsem skozi človeško populacijo. Prašičja gripa se razvije pri prašičih, ko ena žival zboli za več kot eno vrsto gripe, kot sta prašičja gripa in virus človeške gripe. Ko so ti virusi prisotni pri isti živali ob istem času, se lahko podvržejo mutaciji, ki jim bo omogočila širjenje skozi katero koli vrsto. Ker imata prašičja in sezonska gripa tako različen izvor, so na voljo različna cepljenja za boj proti vsaki vrsti gripe.