Obstajata dve primarni skupini bilateralnih (dvostransko simetričnih) živali: protostomi in devterostomi. Imenujejo jih tudi superfila, ker vsaka vsebuje več živalskih tipov. Deuterostomi so ponavadi bolj zapleteni in vključujejo iglokožce, polhordate, hordate (vsi vretenčarji) in nekaj manjših tipov. Protostomi vsebujejo tako rekoč vse ostalo, vključno s členonožci, anelidi, ploščatimi črvi, mehkužci itd. Nekaj majhnih tipov ni uvrščenih niti med druge. Glavna razlika med obema skupinama je, kako se razvijejo kot zarodki: pri protostomah prva odprtina v zarodku postane usta, pri devterostomih pa postane anus.
Večina znanstvenikov prepozna vsaj tri superfile znotraj protostoma – Lophotrochozoa, Edcysozoa in Platyzoa. Te superfile so bile predlagane v letih 1995, 1997 in 1998 na podlagi molekularnih in morfoloških dokazov. Lofotrohozoje (»živali z grebenom«) združuje prisotnost lofofora, obroča cilijastih lovk okoli ust, ki se uporabljajo za prijemanje delcev hrane. Lophotrochozoans, včasih imenovani tudi trohozoji, vključujejo približno ducat tipov: Entoprocta, Mollusca, Annelida, Phoronida, Brachiopoda, Nemertea, Chaetognatha, Bryozoa, Myzostomida, Acoela in Gnathostomulida. Večina lofotrohozojev je morskih, kar je smiselno, saj so pod vodo najbolj uporabne cilijaste ustne lovke za grabljenje hrane.
Poleg lofotrohozojev so še ena pretežno morska superfila protostomov platyzoans (»ploščate živali«), ki vključujejo ploščate črve in številne pomembne mikroskopske, planktonske živali, kot so rotiferji in gastrotrihi. Platyzoans se razlikujejo bodisi po odsotnosti celima (telesne votline) bodisi po zmanjšanem celimu, imenovanem psevdocoel. Platyzoa je v povprečju najpreprostejša superfila protostome, čeprav preproste organizme najdemo tudi med lofotrohozoji. Platyzoans so prej veljali za člane Lophotrochozoa, vendar jim večina znanstvenikov zdaj daje svojo skupino.
Zadnja superfila protostoma so Ecdysozoa, ki jih odlikuje taljenje eksoskeletov (ekdiza). Ecdysozoa je najuspešnejša in najbolj razširjena superfila protostome in vključuje členonožce (rake, žuželke, kelicerate in miriapode), ogorčice (okrogle črve), tardigrade, žametne črve in več manjših tipov. Nematode so ene najštevilčnejših živali na Zemlji, ki jih najdemo v vseh možnih okoljih, vključno z Antarktiko, medtem ko členonožci vsebujejo največ vrst, verjetno več kot 7 milijonov, kar predstavlja več kot 90 % vse živalske biotske raznovrstnosti na Zemlji. Čeprav obstajajo številni drugi organizmi, ki uporabljajo neko obliko lupine ali zunanje povrhnjice, so Ecdysozoa očitno evolucijsko najbolj učinkoviti.