Povezava med rdečimi lasmi in pegami je, da jih oba povzroča gen MC1R. Ta gen je v osnovi odgovoren za proizvodnjo proteina MC1R, ki sodeluje pri distribuciji pigmentov las in kože. Na lase in kožo ljudi vplivata dva glavna pigmenta, eumelanin in feomelanin. Ljudje s pegami in rdečimi lasmi imajo več feomelanina kot ljudje z drugimi barvami las in kožo brez peg. Osnovni razlog za to je, da gen MC1R bodisi deluje – v tem primeru spremeni feomelanin v eumelanin – ali pa ne, kar povzroči kopičenje feomelanina.
Genetika je v bistvu študija o tem, kako se lastnosti prenašajo v genih s staršev na otroke. Vsak otrok dobi dve kopiji vsakega gena, eno od matere in drugo od očeta. Razlike v stvareh, kot sta barva las in barva oči, so povezane z genetiko in jih je mogoče razložiti z različnimi različicami vsakega gena, ki jih je mogoče podedovati od staršev. Tako rdeče lase kot pege lahko povzroči različica istega gena, zato je pri ljudeh s to različico gena večja verjetnost, da bodo razvili te lastnosti.
Razumevanje delovanja gena MC1R je pomembno za razumevanje povezave med rdečimi lasmi in pegami. Gen v bistvu pove telesu, kako proizvaja protein MC1R, ki je odgovoren za upravljanje pigmentov v koži. Pigmenti so različne kemikalije, ki nadzorujejo barvo kože, pri čemer sta eumelanin in feomelanin dva glavna. Feomelanin je veliko redkejši in večina ljudi z delujočim genom MC1R ga pretvori v eumelanin, zaradi česar ima večina ljudi druge barve las kot rdeče. Če gen ne deluje pravilno, se nabira feomelanin, ki povzroča rdeče lase in rdeč videz peg.
Pege nastanejo zaradi neenakomerne porazdelitve celic melanocitov v koži. Večina ljudi ima razširjene melanocite, ki ustvarjajo pigment, ki je odgovoren za spreminjanje barve kože, ko so izpostavljeni soncu. Ljudje z razpršenimi melanociti enakomerno porjavijo, vendar imajo ljudje z gručami le-teh na koncu koncentrirane lise različnih barv, imenovane pege. Gen MC1R lahko povzroči tudi združevanje melanocitnih celic na ta način. Zato imajo ljudje s poškodovanimi geni MC1R pogosto rdeče lase in pege.
Razlog, zakaj imajo nekateri ljudje rdeče lase brez peg ali pege brez rdečih las, je, da prejmejo dve kopiji vsakega gena, eno od matere in eno od očeta. Če je pokvarjen samo en gen, lahko oseba dobi grude melanocitov, ne pa presežka feomelanina. V primerih, ko sta oba zlomljena, bo oseba dobila rdeče lase in pege.