Mejna osebnostna motnja in bipolarna motnja sta dve ločeni diagnozi, ki se v nekaterih primerih zdita zelo podobni, v nekaterih primerih pa gresta skupaj. Oba vključujeta, da bolniki kolesarijo od maničnih razpoloženj, za katere so značilni visoka energija, pozitivna čustva in impulzivno vedenje, do depresivnih razpoloženj, kjer se oseba počuti žalostno, razdraženo in letargično. Bolnikom z mejno osebnostno motnjo je bipolarna diagnoza običajno nekoliko pogostejša kot pri bolnikih z drugimi osebnostnimi motnjami, kar kaže na možno povezavo med obema. Vendar se zdi, da so osnovni vzroki za obe motnji različni; Zdi se, da je bipolarna motnja povezana s kemičnim neravnovesjem v možganih, medtem ko se zdi, da je mejna osebnostna motnja tesno povezana z zapoznelim osebnim in čustvenim razvojem.
Simptomi mejne osebnostne motnje in bipolarne motnje so lahko pogosto enaki, čeprav obstajajo dejavniki, ki jih razlikujejo. Primarna značilnost obeh motenj je prehod iz maničnih v depresivno razpoloženje; bolniki lahko preidejo od občutka sreče, navdušenja in energije do nizke energije in negativnega občutka. Predstavitev teh simptomov pa se razlikuje po tem, kako pogosto bolniki spreminjajo razpoloženje; tisti z bipolarno motnjo običajno ohranjajo enako razpoloženje več tednov ali mesecev, preden pridejo do spremembe, medtem ko lahko ljudje z mejno osebnostno motnjo prehajajo med razpoloženji zelo hitro, vsak dan ali celo uro.
Zdi se, da obstaja neka možna povezava med verjetnostjo diagnoze tako mejne osebnostne motnje kot bipolarne motnje. Študije so pokazale, da obstaja večja verjetnost, da se bo v povezavi z mejno osebnostjo pojavila bipolarna motnja kot pri drugih vrstah osebnostnih motenj. Vendar se povezava ne šteje za močno in je lahko tudi posledica napačne diagnoze zaradi podobnih simptomov obeh.
Čeprav se lahko mejna osebnostna motnja in bipolarna motnja pogosto pojavljata na podobne načine, se na splošno strinjajo, da so temeljni vzroki za vsako zelo različni. Epizode nihanja razpoloženja pri bipolarnih bolnikih, na primer, se pogosto zdijo brez očitnega razloga; to kaže na težave s kemijo možganov, ki naj bi jih sprožila. Po drugi strani pa tisti z mejno osebnostno motnjo pogosto doživljajo spremembe v razpoloženju kot odziv na okoljske ali situacijske stresorje. To se običajno pripisuje dejstvu, da se šteje, da ti bolniki trpijo zaradi pomanjkanja čustvene zrelosti, zaradi česar gledajo na situacije črno-belo, zaradi česar so zelo občutljivi in temperamentni.