O natančni povezavi med kapsaicinom in rakom se veliko razpravlja, saj so študije pokazale nekaj nasprotujočih si rezultatov. Nekatere raziskave so pokazale, da kapsaicin, ki je pogosta snov v čili papriki, lahko poveča tveganje za kožni rak. Številne druge študije so pokazale, da je kapsaicin lahko močan borec proti raku in da se številne vrste rakavih celic dejansko uničijo, ko se snov uporabi. Večina raziskav, vključno s tistimi, ki jih podpirajo številni raziskovalni centri za raka, podpira uporabo kapsaicina.
Študije o zdravljenju kapsaicina in raka so uporabo te snovi v prvi vrsti povezale z zdravljenjem raka prostate, čeprav je rak na jetrih in nekatere druge mogoče ustaviti tudi z zdravljenjem. Ko gre za zdravljenje raka, običajno ni dovolj samo jesti več čili paprike. Visoke odmerke snovi je treba jemati, da imajo dovolj velik učinek za zdravljenje bolezni, ko je rak že diagnosticiran. Kljub nekaterim obetajočim povezavam med kapsaicinom in zdravljenjem raka bi se morali na novo diagnosticirani bolniki z rakom pogovoriti z zdravnikom, da določi pravi način zdravljenja za uporabo.
Nekateri zdravstveni delavci priporočajo jemanje kapsaicina kot del zdravljenja raka. Dodatke kapsaicina ali kajenskega popra lahko kupite v večini trgovin z zdravo hrano ali na spletu pri specializiranih prodajalcih. Ker lahko nudijo tudi številne druge koristi za zdravje, običajno ni škode pri jemanju tablet kapsaicina kot del dnevnih dodatkov.
Večina splošnih zdravstvenih ustanov trenutno ne priporoča kapsaicina za uporabo kot zdravljenje raka, čeprav si raziskovalci prizadevajo najti način za razvoj zdravil, ki vsebujejo to snov, ali posnemanje njenih rezultatov. Številni zdravstveni delavci trdijo, da je razlog, da medicinski strokovnjaki ne promovirajo kapsaicina, ker je relativno nizka cena in farmacevtskim podjetjem ne bi prinesla denarja. Drugi trdijo, da bi bilo pretežko zaužiti dovolj snovi samo z dodatki. Ker je tako malo znanega o dolgotrajni uporabi kapsaicina v velikih odmerkih, se je najbolje izogibati prevelikim količinam, razen pod nadzorom zdravnika ali holističnega zdravnika.
Obstaja nekaj nasprotujočih si študij o povezavi med kapsaicinom in rakom. Čeprav je bila večina pozitivnih, so nekatere študije pokazale, da lahko snov poveča tveganje za kožni rak. Druge raziskave so bile v nasprotju s temi ugotovitvami in niso pokazale povezave med obema. Kapsaicin na splošno velja za varnega za uporabo, saj se je v številnih študijah izkazalo tudi za koristno pri pospeševanju presnove in preprečevanju nekaterih možganskih motenj. Potrošnike priporočamo, da se pred jemanjem kakršnih koli zdravil ali dodatkov posvetujejo z zdravstvenim delavcem.