Tako jajčniki kot jajcevodi so del ženskega reproduktivnega trakta. Med tema dvema strukturama obstajajo številne druge povezave, vključno z njihovo fizično bližino in dejstvom, da imata obe pomembno vlogo pri spodbujanju plodnosti. Obe strukturi sta lahko povezani tudi pri različnih patoloških stanjih. Okužbe medenice lahko prizadenejo tako jajčnike kot jajcevode, prav tako tudi stanja, kot so endometrioza ali fibroidi. Poleg tega lahko nenormalnosti v delovanju katerega koli od teh delov reproduktivnega trakta povzročijo neplodnost.
Ena od pomembnih povezav med jajčniki in jajcevodi je, da se nahajajo drug ob drugem v medeničnem predelu žensk. Normalne ženske imajo dva jajcevoda in dva jajčnika. Dve jajcevodi segata od zgornje površine maternice, obe pa se raztezata bočno v nasprotni smeri. Na koncu jajcevodov se valjaste strukture povečajo v premeru in segajo v fimbrije, ki so prstaste izbokline, ki zibajo jajčnike. Konci jajcevodov so odprti, kar omogoča, da jajčeca, ki izbruhnejo iz jajčnikov, potujejo v notranji del maternice.
Druga povezava med jajčniki in jajcevodi je, da oba delujeta tako, da olajšata razmnoževanje. Jajčniki so strukture, v katerih so shranjena jajčeca. Z vsakim mesečnim menstrualnim ciklusom se eno od teh jajčec razvije v zrelost, ob ovulaciji pa izbruhne iz jajčnika in v ustje jajcevoda. V nekaj dneh zrelo jajčece potuje skozi jajcevod in če je katera koli semenčica potovala navzgor skozi reproduktivni trakt, je oplojena. Oplojeno jajčece nato nadaljuje potovanje skozi jajcevod in se vsadi v notranjo steno maternice.
Nekatera enaka patološka stanja lahko prizadenejo tako jajčnike kot jajcevode. Pogosto se lahko v primeru medenične vnetne bolezni (PID) okužita oba dela ženske anatomije. Ko se to zgodi, bakterije potujejo iz nožnice, skozi maternični vrat, v maternico in skozi jajcevode. Občasno lahko bakterije povzročijo tubo-jajčni absces (TOA), ki je vnetje tako jajcevodov kot jajčnikov, kar povzroči okuženo maso, ki jo je mogoče vizualizirati z različnimi slikovnimi študijami. Ta okužba je lahko kratkoročno smrtno nevarna, dolgoročno pa povzroča težave s plodnostjo.
Različna druga patološka stanja lahko prizadenejo tako jajčnike kot jajcevode. Endometrioza, ki je stanje, pri katerem maternično tkivo raste izven maternice, lahko prizadene obe ti anatomski strukturi. Pogosto lahko to stanje povzroči hude bolečine in težave s plodnostjo. Fibroidi, ki so benigne izrastke maternične mišice, lahko narastejo tako velike, da stisnejo jajčnike in jajčnike, kar zavira njihovo normalno delovanje.