Elektronsko izbrisljivi programirljivi pomnilnik samo za branje (EEPROM) in bliskovni pomnilnik imata veliko skupnega. Tako EEPROM kot bliskovni pomnilnik sta zgrajena na formatu čipa, lahko shranjujeta podatke, ki jih je mogoče izbrisati in prepisati, in uporabljajo isto tehnologijo tranzistorjev s plavajočimi vrati. Čeprav je pravilno trditi, da je bliskovni pomnilnik vrsta EEPROM-a, izraza EEPROM in bliskovni pomnilnik običajno opisujeta različne naprave.
EEPROM se na splošno nanaša na katero koli vrsto podatkovne pomnilniške naprave, ki ima lahko digitalne podatke zapisane vanjo in izbriše z uporabo neke vrste elektronske naprave. To je v nasprotju z izbrisljivim programirljivim pomnilnikom samo za branje (EPROM), ki ga je treba fizično odstraniti in izbrisati z neelektronsko metodo, na primer z ultravijolično svetlobo. Ker se izvajanja zapisovanja in brisanja bliskovnega pomnilnika izvajajo z računalnikom, je bliskovni pomnilnik po definiciji EEPROM.
Čeprav je bliskovni pomnilnik vrsta EEPROM-a, ta izraza običajno opisujeta zelo različne vrste naprav. Na primer, EEPROM je običajno vgrajen v večje integrirano vezje (IC). Služi funkciji shranjevanja različnih podatkov, ki jih preostali del IC potrebuje za dosego svojega namena. EEPROM to naredi tako, da podatke shrani v majhne bloke, običajno le en bajt.
Po drugi strani pa se bliskovni pomnilnik običajno uporablja v samostojnih pomnilniških napravah, kot so pogoni USB ali pomnilniške kartice fotoaparata, in shranjuje uporabniške datoteke računalnika. Za to so podatki organizirani v velike bloke, od katerih vsak vsebuje veliko bajtov podatkov. Do teh velikih blokov je mogoče dostopati in jih izbrisati veliko hitreje kot enobajtne bloke podatkov. Ta veliko večja hitrost pri ravnanju s podatki je razlog, da bliskovni pomnilnik dobi svoje ime.
EEPROM in bliskovni pomnilnik uporabljata tranzistorje s plavajočimi vrati za shranjevanje podatkov. Posledično sta obe obliki pomnilnika nehlapni. Nehlapni se nanaša na pomnilnik, ki lahko še naprej shranjuje podatke, tudi če ni na voljo energije. To je v nasprotju z drugimi vrstami pomnilnika, kot je računalniški pomnilnik z naključnim dostopom, ki izpiše vse shranjene podatke takoj, ko je napajanje izklopljeno.
Druga skupna lastnost tehnologij, ki temeljijo na tranzistorjih s plavajočimi vrati, je omejen življenjski cikel tranzistorjev zaradi pojava, imenovanega obraba spomina. Vsakič, ko se podatki zapišejo ali izbrišejo iz teh naprav, pride do nekoliko več obrabe. Sčasoma, po 10,000 do 100,000 ciklih, bodo tranzistorji začeli odpovedovati. Medtem ko EEPROM vsebuje operativne podatke, ki se redko spreminjajo, se podatki, shranjeni v flash pomnilniku, pogosto spreminjajo. Čeprav se tako EEPROM kot bliskovni pomnilnik obrabljata, ima običajno veliko večji učinek na bliskovni pomnilnik.