Kljub široki paleti različnih mišic, ki pritrdijo in premikajo skeletno strukturo, je anatomija skeletnih mišic v bistvu enaka po vsem telesu. Skeletne mišice so sestavljene iz dolgih večjedrnih celic, ki so valjaste oblike. Mišice so skoraj vedno pritrjene neposredno na kosti in so za razliko od drugih dveh vrst mišic, srčne in gladke, pod prostovoljnim nadzorom. Skeletne mišice imajo veliko plasti in membran, ki ščitijo in delijo njihove različne komponente. Večjedrne celice lahko imenujemo tudi vlakna, ki se združujejo v snope, odvisno od prostovoljnega delovanja, ki ga nadzorujejo.
Prva plast skeletnih mišic je tanka, elastična membrana, imenovana sarkolema, ki pokriva posamezne celice. Glavna funkcija sarkoleme je ohraniti vse različne celične komponente nedotaknjene, podobno kot celična membrana deluje v drugih celicah telesa. V sarkolemi tekočina mišične celice ali sarkoplazma vsebuje pl, miofibrilo. Vsako posamezno vlakno vsebuje številne miofibrile, ki so beljakovinske niti, ki potekajo po celotni dolžini mišičnega vlakna. Te strukture ležijo drug ob drugem in so odgovorne za podaljšanje in krčenje mišice na signal centralnega živčnega sistema (CNS).
Miofibrile je mogoče nadalje razrezati na drugo komponento, ki je bolj neposredno vključena v krčenje in podaljševanje vlakna, sarkomer. Sarkomeri delujejo kot drobne verige kontraktilnega tkiva, ki so poravnane od konca do konca po vsej miofibrili. Na mikroskopski ravni je miofibril sestavljen iz še finejšega proteina, imenovanega miofilament. Proteini miofilamenta so sestavljeni iz temnih niti ali anizotropnih (A) pasov in svetlih niti ali izotropnih (I) pasov; kontrastno obarvani proteini dajejo skeletnim mišicam progast videz. A-pasovi in I-pasovi miofilamenta so odgovorni tudi za presnovo adenozin trifosfata (ATP), ki sproži krčenje mišic.
Na makroskopski ravni so skeletne mišice sestavljene iz različnih plasti. Najbolj zunanji se imenuje epimizij in ščiti skeletne mišice pred škodljivim trenjem, do katerega bi lahko prišlo, ko se premikajo ob druge mišice in kosti. Epimizij je še posebej pomembna sestavina v anatomiji skeletnih mišic, saj skupaj z drugimi vezivnimi tkivi tvori mišično tetivo. Mišična tetiva je močna, vlaknasta “vrv”, ki preprečuje, da bi mišice zdrsnile s pritrdilnih točk na kosteh.