Odstranjevanje vodnih odpadkov je problem, s katerim se soočajo številne korporacije in številne občine. Cilj je najti okolju najbolj prijazen način ravnanja z odlaganjem, hkrati pa ohraniti čim nižje stroške, povezane z odlaganjem. Danes sta v skupni uporabi dve običajni metodi odstranjevanja vodnih odpadkov, pri čemer je vsaka v določenih okoliščinah izvedljiva možnost.
Najstarejši način odstranjevanja vodnih odpadkov je preprosto odstranjevanje odpadne vode z mesta. Stoletja je bila to običajna metoda za odstranjevanje vode, onesnažene z mešanico raztopljenih ali suspendiranih trdnih snovi. V zadnjih letih so se stroški, povezani s tem pristopom, znatno povečali, saj so odlagališča za odpadno vodo vse manjša. Kljub temu je ta pristop naklonjen mnogim podjetjem, ki nimajo tehnologije za predelavo vode na kakršen koli drug način.
Sodobnejša rešitev problema odstranjevanja vodnih odpadkov je vzpostavitev objektov, ki jih je mogoče uporabiti za čiščenje vode. Ta postopek obratovanja obrata za odpadno vodo na kraju samem omogoča recikliranje vode, v nekaterih primerih pa tudi zmanjšanje odpadkov v nekakšen uporaben izdelek. S to rešitvijo se ni treba obremenjevati s stroški transporta odpadne vode na oddaljeno lokacijo. Poleg prihranka časa in denarja prizadevanja za recikliranje pomenijo tudi manjše povpraševanje po lokalnih virih, kar je dobro za okolje.
Druga možnost vključuje najem podjetja za čiščenje vode, ki bo opravilo čiščenje vode. Ta pristop k odlaganju vodnih odpadkov je pogosto privlačen za podjetja, ki nimajo zmogljivosti za čiščenje vode, ki pa jih tudi ne zanima transport odpadne vode na kakšno oddaljeno lokacijo. Tovrstno ravnanje z vodnimi odpadki deluje zelo dobro, saj lahko nekatere službe vodo očistijo na kraju samem ali pa vodo odpeljejo na kratke razdalje, kjer jo očistijo in naredijo primerno za druge namene.
Določanje najboljše metode za odstranjevanje vodnih odpadkov vključuje natančno preučitev virov, ki so na voljo na območju, in morebitnih predpisov v zvezi s pravilnim ravnanjem z odpadnimi vodami, ki jih je sprejela lokalna jurisdikcija. Skladnost z lokalno zakonodajo je nujna za nadaljevanje delovanja proizvodnega obrata ali drugega podjetja na tem območju. Na srečo številne jurisdikcije poskrbijo tudi za to, da so predpisi strukturirani tako, da lahko podjetja, ki delujejo lokalno, uporabijo razpoložljiva sredstva za izpolnjevanje postavljenih standardov in nadaljujejo poslovanje na dolgi rok.