Zdravljenje otekline penisa je odvisno od vzroka. Če ima moški penis otekel zaradi manjše poškodbe tega območja, bi lahko pomagala uporaba ledenega obkladka. Pogosto pa so kriva stanja, kot so balanitis, Peyroniejeva bolezen in priapizem. Včasih otekanje penisa po določenem času mine samo od sebe, v drugih primerih pa so potrebne injekcije, zdravila ali kirurško zdravljenje. V nekaterih primerih pomaga tudi zdravljenje stanja, ki je povzročilo oteklino.
Balanitis je stanje, ki lahko povzroči otekanje penisa. Zaznamuje ga oteklina, ki prizadene glavo tega organa, ne pa tudi gred. Če je moški neobrezan, lahko prizadene tudi njegovo kožico, včasih pa se ob oteklini penisa pojavi izpuščaj, vidna pordelost, bolečina in nenormalni izcedek. Balanitis je običajno posledica okužbe, draženja ali neustrezno zdravljenega zdravstvenega stanja in je pogostejši pri moških, ki niso bili obrezani. Zdravljenje je odvisno od težave, ki jo je povzročila, vendar lahko vključuje antibiotike, ki jih jemljemo peroralno ali lokalno, oskrbo vseh osnovnih stanj in včasih obrezovanje.
Moški ima lahko tudi otekanje tega organa zaradi stanja, imenovanega priapizem. To stanje zaznamuje pokončen penis, ki se po izgubi orgazma ali vzburjenja ne vrne v svoje ohlapno stanje. Sčasoma lahko ta težava povzroči brazgotinjenje tkiva penisa, kar vodi do trajnih poškodb. Zdravniki ga običajno zdravijo z odvajanjem krvi iz penisa, z zdravili, ki ovirajo pretok krvi v genitalije, z zdravljenjem stanj, ki so ga povzročila, ali z operacijo.
Otekanje penisa se včasih začne kot navidezno manjša težava, ki je omejena na en del penisa in jo spremlja draženje. Sčasoma pa lahko razdraženo, otečeno območje tvori trdo liso v penisu in celo povzroči, da se penis upogne. To včasih boleče stanje imenujemo Peyroniejeva bolezen. Zdravniki niso prepričani, kaj povzroča stanje, in ne zahteva vedno zdravljenja. Čeprav lahko traja več mesecev, pogosto mine samo od sebe.
Kadar se Peyroniejeva bolezen ne izboljša sama ali če povzroča zmerno do hudo bolečino, jo lahko zdravnik popravi kirurško ali z injekcijami. Operacija pogosto vključuje izrezovanje utrjenega dela iz penisa in njegovo zamenjavo z zdravim tkivom, medtem ko se injekcije uporabljajo za mehčanje tkiva na prizadetem območju. Zdravnikovo priporočilo za zdravljenje je običajno odvisno od resnosti stanja.