Melatonin, naravni hormon, ki ga izloča epifiza v možganih, se včasih daje otrokom, da jim pomaga premagati nespečnost in hitro in naravno zaspati. Obstaja nekaj skrbi, da lahko predhodnik melatonina, če ga dajemo v njegovi sintetični obliki, zviša raven sladkorja v krvi in prispeva k razvoju motenj krvnega sladkorja. Neželeni učinki melatonina pri otrocih so razmeroma nizki, kar kaže, da ga večina otrok lahko jemlje z ali brez zdravniškega naročila. Čeprav se zdi, da je melatonin varen in učinkovit za pomoč otrokom, da zaspijo, dolgotrajne študije niso pokazale, ali se neželeni učinki pojavijo pozneje.
Z nastopom teme možgani naravno izločajo hormon melatonin, ki telo pripravi na počitek in spanje. Mnogi starši se odločijo, da je uporaba melatonina za otroke varnejša metoda za pomoč tistim, ki trpijo zaradi pomanjkanja proizvodnje melatonina ali drugih motenj, povezanih s spanjem. Dokazano je, da lahko melatonin, če ga jemljemo kot dodatek, pri nekaterih posameznikih zviša raven sladkorja v krvi in lahko sčasoma prispeva k nestabilnosti krvnega sladkorja. Nekateri zdravniki opozarjajo, da se je treba melatoninu pri otrocih, ki trpijo za sladkorno boleznijo, izogibati, saj lahko povzroči nenadzorovano in nestabilno raven sladkorja v krvi.
Klinična preskušanja melatonina za otroke kažejo, da so stranski učinki, kot so bruhanje, zaprtje in izguba ali pridobivanje teže, relativno redki. Dodatni melatonin lahko jemljete brez zdravniškega soglasja, deloma zaradi njegove varnosti v zmernih količinah, vendar se lahko pojavijo neželeni učinki brez ustreznega odmerjanja. Zdravniki se raje pogovorijo s starši, da določijo pravilen odmerek za otrokovo starost, telesno težo in višino. Ker melatonin ni strogo urejen s strani nobene vladne agencije, lahko pogovor z zdravnikom pomaga preprečiti napake pri odmerjanju, saj lahko preveliko odmerjanje povzroči glavobole ali nihanje razpoloženja.
Večina študij o melatoninu za otroke je bila namenjena tistim, ki trpijo za avtizmom ali slepoto, in drugim otrokom z nevrološkimi motnjami. Zaradi tega so številni kritiki in zdravniki previdni pri uporabi melatonina vsak večer za zdrave otroke, saj dolgoročni učinki niso bili temeljito raziskani. Sintetični dodatni melatonin se na splošno šteje za varnega, vendar ga je treba uporabljati le v primeru občasne nespečnosti pri otrocih in odraslih. Strokovnjaki za spanje pogosto najprej predlagajo preprostejše alternative, kot so zmanjšanje kofeina, televizije in drugih stimulativnih dejavnosti eno uro pred spanjem.