Na splošno je za peko mogoče uporabiti margarino, če gre za pristno margarino z dovolj visoko vsebnostjo maščob. Pravo margarino lahko v enakih količinah nadomestimo z maslom, čeprav bo pečeni jedi dala drugačen okus. Obstaja več modificiranih ali mešanih različic margarine, ki morda niso primerne za peko, vendar predvsem zato, ker nimajo dovolj maščobe, da bi povzročile potrebne reakcije v živilih, in ker imajo visoko vsebnost vode. Za peko se je najbolje izogibati nemastni margarini, pa tudi izdelkom, ki so pakirani kot margarina, vendar so označeni kot namazi ali nadomestki. Margarina ima drugačne lastnosti kot maslo, zato je pri uporabi margarine za peko koristno, da jo zamrznete pred kremanjem, bodite še posebej previdni pri taljenju in upoštevajte morebitne dodatke, kot so arome, ki bi jih lahko dodali med proizvodnjo.
Prava margarina je narejena predvsem iz maščob, ki so pridobljene iz rastlinskih olj. Opredelitev »prave margarine« je, da mora vsebovati vsaj 80 odstotkov maščobe, zaradi česar je v tem pogledu enakovredna maslu in omogoča uporabo margarine za peko skoraj vseh vrst hrane. Listnato testo in bonboni na osnovi sirupa sta dve izjemi, razen če so bili recepti posebej razviti za uporabo margarine. Količina maščobe v margarini se včasih zmanjša, da se naredi izdelek z nizko vsebnostjo maščob ali brez maščob, ki bi lahko bil – ali pa ne – primeren za peko. Na splošno lahko za peko uporabimo margarino, ki ima več kot 50 odstotkov maščobe.
Če v margarini zmanjšamo količino maščobe, jo pogosto nadomestimo z vodo. Pri uporabi margarine za peko lahko odvečna voda testo ali testo hitro spremeni v zelo mokasto zmes, zato se ji je treba izogibati. Nekateri recepti upoštevajo dodatno vodo v nemastnih margarinah in temu ustrezno prilagodijo preostale sestavine. V teh primerih lahko uporaba margarine z visoko vsebnostjo maščob za peko povzroči, da je testo presuho.
Če recept zahteva, da margarino kremamo ali stepemo s sladkorjem, potem je to lažje, če margarino najprej delno zamrznemo. To mu bo pomagalo ohraniti svojo strukturo med stepanjem. Poleg tega je tališče margarine nižje kot pri maslu, kar pomeni, da se bo margarina hitreje stopila. Nekatere margarine imajo dodatke, kot so arome ali sol, ki lahko vplivajo na okus končne jedi, zato je pri izbiri ustrezne margarine za peko morda potrebno poznavanje njenih sestavin.