Uporaba ustne vode za bakterije je na splošno zelo učinkovita, vendar imajo nekatere vrste ustne vode manjši učinek kot druge. Na splošno lahko vsaka ustna voda, označena kot “antiseptik”, ubije bakterije, vendar je količina bakterij, ki jih lahko ubije, odvisna od koncentracije aktivne sestavine. Nekatere ustne vodice so neuporabne pri ubijanju bakterij in namesto tega uporabljajo olje poprove mete za preprečevanje slabega zadaha, povezanega z rastjo bakterij v ustih. Učinkovite sestavine ustne vode za bakterije vključujejo alkohol, natrijev fluorid in vodikov peroksid. Čeprav alkohol običajno velja za učinkovit ubijalec bakterij, pa tudi izsuši usta, kar lahko poslabša težavo.
Najpomembnejša stvar, na katero morajo nakupovalci paziti pri nakupu ustne vode, je vključitev besede »antiseptik« na etiketo. Antiseptik je opredeljen kot sposoben očistiti območje brez bakterij ali mikroorganizmov. Nekatere ustne vodice samo prikrijejo vonj slabega zadaha z nečim, kot je olje poprove mete. Te ustne vode bi se morali izogibati ljudje, ki trpijo zaradi slabega zadaha, ker se ne borijo proti bakterijam, temveč samo proti vonju. Večina ustne vode bo imela antiseptični učinek, vendar natančna metoda, ki jo uporabljajo za ustvarjanje tega učinka, lahko pomaga ugotoviti, katera je na splošno učinkovitejša.
Alkohol je pogost v ustni vodi zaradi svojih lastnosti za boj proti bakterijam. Tehnično gledano je 70-odstotna koncentracija alkohola najučinkovitejša v boju proti bakterijam, vendar lahko tako visoka vsebnost alkohola v ustni vodi povzroči težave. Poleg možnosti, da otroci pijejo ustno vodico zaradi vsebnosti alkohola, je znano, da alkohol izsuši usta. Ljudje s suhimi usti imajo tudi slab zadah, zato alkoholna ustna voda ubija bakterije, vendar ne vpliva na končni rezultat te težave. Zato so ustne vode, ki ne vsebujejo alkohola, imajo pa drugo sredstvo za ubijanje bakterij, učinkovitejše.
Druge možne sestavine v ustni vodi za preprečevanje in zmanjšanje bakterij vključujejo natrijev fluorid in vodikov peroksid. Vodikov peroksid lahko še vedno povzroči sušenje ust, vendar to ni tako izrazito kot učinek, ki ga povzroča alkohol. Natrijev fluorid je še ena možna sestavina ustne vode za preprečevanje bakterij. Običajno se ta kemikalija uporablja v pesticidih, vendar so raziskave pokazale, da so ustne vodice, ki jo vsebujejo, učinkovite pri ubijanju bakterij. Fluorid pomaga tudi pri boju proti kariesu.
Na splošno bo večina blagovnih znamk ustne vode učinkovita pri ubijanju bakterij. Uporaba ustne vodice za bakterije je predvsem za boj proti slabemu zadahu, zato blagovne znamke, ki vsebujejo alkohol, niso tako učinkovite kot znamke brez alkohola. Pomembno je omeniti, da bi morali ljudje, ki trpijo zaradi slabega zadaha, tudi redno umivati zobe in uporabljati zobno nitko, da bi odpravili težavo.