Laparoskopska kirurgija je najpogostejši postopek za diagnosticiranje endometrioze in odstranitev endometrijskih cist – nekanceroznih mas, ki vsebujejo delce endometrijskega tkiva. Glede na pacientko in resnost njene endometrioze je lahko laparoskopska operacija izjemno učinkovito zdravljenje. Operacija je minimalno invazivna in se običajno izvaja ambulantno. Bolniki pogosto občutijo takojšnje olajšanje bolečine in v mnogih primerih je možna povečana plodnost. Rezultati operacije so lahko trajni, vendar se pri mnogih ženskah pojavijo ponovitve in zahtevajo nadaljnje zdravljenje.
Med laparoskopsko operacijo endometrioze se na dnu naval naredi majhen rez. Trebuh je napolnjen s plinom – običajno ogljikovim dioksidom –, ki napihne trebuh, kar omogoča zdravniku, da lažje vidi, ko vstavi laparoskop, majhen, osvetljen instrument s kamero, ki kirurgu omogoča, da pregleda maternico in jajčnike svoje pacientke brez delati odprto operacijo. Pogosto se za diagnosticiranje endometrioze izvaja laparoskopska operacija. Če najdemo endometriom, ga lahko odstranimo. V ta namen bo kirurg naredil enega ali več dodatnih rezov v trebuhu, skozi katere lahko vstavi svoje kirurške instrumente.
Ginekolog lahko priporoči laparoskopsko operacijo za endometriozo, če ima pacientka nenormalno bolečino, povezano z menstrualnim ciklusom, neplodnostjo ali drugimi simptomi endometrioze. Prednost laparoskopske kirurgije za endometriozo je, da je relativno kratek postopek, ki običajno traja od 30 do 45 minut. Lahko se izvaja ambulantno, čas okrevanja po operaciji pa je običajno le nekaj dni do enega tedna. Za ženske, ki imajo bolečine v trebuhu, lahko laparoskopska operacija v mnogih primerih zagotovi takojšnje lajšanje bolečin, medtem ko alternativno zdravljenje, kot je hormonska terapija, morda ne.
Za ženske, ki iščejo olajšanje bolečine, povezane z endometriozo, je laparoskopska operacija učinkovita pri 70 do 100 % žensk v prvih mesecih po operaciji. Pri 45 % žensk se simptomi ponovijo v prvem letu po operaciji. Bolj kot je endometrioza napredovala, večja je verjetnost, da bo ženska doživela ponovitev endometrioze ali bolečine v endometriju. Med laparoskopsko operacijo endometrioze lahko kirurg izsuši ali izreže del endometrioma ali pa popolnoma odstrani endometrijsko cisto. Mnogi zdravniki priporočajo popolno odstranitev kot najučinkovitejšo metodo za lajšanje bolečin endometrija in za preprečevanje ponovitve endometrioze.
Ženske, katerih neplodnost je povezana z endometriozo, imajo različne rezultate po laparoskopski operaciji endometrioze. Zdi se, da je laparoskopija manj učinkovita pri blagih primerih endometrioze. Vendar pa je v zmernih do težkih primerih lahko laparoskopska operacija za endometriozo koristna in lahko povzroči povečanje plodnosti. Drugi dejavniki, ki močno določajo plodnost ženske po laparoskopski operaciji zaradi endometrioze, vključujejo njeno starost, sposobnost preživetja njenih jajčec in tveganje za spontani splav.