Uporaba vankomicina za pljučnico je na splošno učinkovito zdravljenje, vendar se pred obravnavo zdravila priporočajo druga zdravljenja. Razlog za to je, da so druga zdravljenja z zdravili enako ali bolj primerna za večino primerov pljučnice, saj imajo 80-odstotno možnost za ozdravitev bolezni. Vankomicin se zato priporoča le v primerih, ko je bolezen odporna na druge oblike zdravljenja. Večina primerov pljučnice se na splošno odziva na antibiotike, zato uporaba vankomicina običajno ni potrebna. Če bi se zdravniki odločili za redno uporabo vankomicina za zdravljenje pljučnice, bi lahko bakterije, ki povzročajo to stanje, postale odporne na učinke zdravila in jih je zato težje zdraviti.
Na splošno je uporaba vankomicina za pljučnico učinkovita. To je zato, ker je vankomicin antibiotik, skupaj z drugimi zdravili, kot je doksiciklin. Vsako zdravljenje z antibiotiki ima približno 80-odstotno možnost za ozdravitev bakterijske pljučnice, kar pomeni, da uporaba enega posebnega zdravila za zdravljenje vseh primerov ni potrebna. V skladu s to splošno učinkovitostjo zdravil iz istega razreda lahko vankomicin ozdravi večino primerov pljučnice.
Kadar se antibiotiki pogosto uporabljajo za boj proti bakterijskim okužbam, kot je pljučnica, se lahko bakterije v bistvu razvijejo in postanejo odporne na zdravljenje. To pomeni, da zdravila prve izbire za težave, kot je ta, sčasoma prenehajo delovati. Zaradi tega standardna zdravljenja, ki se uporabljajo za zdravljenje okužb, nimajo vedno učinka, ker so bakterije postale odporne. V teh situacijah se vankomicin pogosto uporablja kot rezervno zdravljenje, na katerega bakterije niso odporne. Uporaba vankomicina za pljučnico je priporočljiva le v teh primerih.
Zdravniki bi se lahko odločili za uporabo vankomicina za zdravljenje pljučnice, ki jo povzročajo bakterije ves čas. Logično, ker bakterije na splošno niso odporne proti njemu, bi ga lahko obravnavali kot boljše zdravljenje od drugih, na katere so bakterije odporne. Ta način razmišljanja ima na žalost usodno napako, saj bi pogosta uporaba vankomicina za pljučnico omogočila bakterijam, da postanejo odporne nanj. Če bi zdravniki vedno uporabljali vankomicin, bi se bakterije »razvile« in nanje prenehale vplivati. Da bi zagotovili nadaljnjo učinkovitost zdravljenja, ga zdravniki uporabljajo le, kadar je to nujno potrebno.
Bolnike, za katere obstaja sum, da imajo bakterijski meningitis, ali kritično bolne otroke lahko zdravimo z vankomicinom. To so posebne situacije, v katerih je bolj verjetno, da bo vankomicin učinkovit. Pri bolnikih, ki trpijo za bakterijskim meningitisom in pljučnico, je zdravilo na splošno učinkovito proti meningitisu, zato je primernejše zdravljenje za bolnika kot celoto. Otroci, ki so kritično bolni, se lahko zdravijo z vankomicinom za pljučnico, da se odpravi tveganje, da bi bile bakterije odporne na druga zdravljenja in tako omogočile, da se njihovo stanje degenerira.