Dajanje azatioprina za ulcerozni kolitis je lahko v nekaterih primerih koristno in učinkovito zdravljenje. Azatioprin je učinkovit pri zdravljenju ulceroznega kolitisa, ker zdravilo deluje tako, da zavira prekomerno aktiven imunski sistem, ki povzroča to bolezen. Glavni primer, v katerem je dajanje azatioprina za ulcerozni kolitis učinkovito, je omogočiti zdravnikom, da zmanjšajo odmerek zdravil, imenovanih kortikosteroidi, ki se običajno dajejo za to bolezen. Čeprav lahko kortikosteroidi preprečijo pojav simptomov, ima lahko njihova dolgotrajna uporaba v velikih odmerkih škodljive stranske učinke.
Uporaba azatioprina za ulcerozni kolitis se je izkazala za učinkovito pri številnih različnih bolnikih, ki trpijo za to boleznijo. Učinkovito je, ker spreminja imunski sistem telesa. Natančneje, zavira proces nastajanja deoksiribonukleinske kisline (DNK) v telesu in selektivno zavira delovanje nekaterih belih krvnih celic, ki igrajo vlogo pri imunskem sistemu telesa. Ker je ulcerozni kolitis avtoimunska bolezen, ki jo deloma povzroča prekomerno aktiven imunski sistem, ki napada domače dele človeškega telesa, zatiranje imunskega odziva telesa vodi v klinično regresijo bolezni.
Vseh bolnikov z ulceroznim kolitisom ne smemo zdraviti z azatioprinom. To zdravilo je najbolj uporabno, če ga dajemo za vzdrževanje remisije bolezni. Bolniki z ulceroznim kolitisom imajo običajno izbruhe aktivnosti bolezni in med temi izbruhi bolezni doživljajo akutno poslabšanje simptomov, vključno s krvavo drisko, bolečino v trebuhu in zvišano telesno temperaturo. Sam izbruh se pogosto zdravi z zdravili, imenovanimi kortikosteroidi, da bi umirili aktivnost bolezni in omogočili remisijo. Ko simptomi začnejo izginjati, se odmerki kortikosteroidov zmanjšajo, kot jih prenašamo.
Če bolnikov po akutnem izbruhu ni mogoče popolnoma odstaviti od kortikosteroidov, je ena od možnosti uporaba azatioprina za ulcerozni kolitis. Dodajanje tega zdravila pogosto omogoča zdravnikom, da zmanjšajo odmerke kortikosteroidov, kar je koristno, saj ima lahko dolgotrajna uporaba kortikosteroidov pomembne stranske učinke. V nekaterih primerih dodajanje azatioprina omogoča, da bolniki popolnoma prenehajo jemati kortikosteroide. Nekateri strokovnjaki menijo, da je uporaba samega azatioprina sporna, zato priporočajo nadaljnjo uporabo kortikosteroidov in azatioprina za preprečevanje nadaljnjih izbruhov bolezni.
Eno opozorilo za uporabo azatioprina za ulcerozni kolitis je, da je treba pred začetkom zdravljenja s tem zdravilom pri bolnikih, ki trpijo za to vnetno črevesno bolezen, opraviti številne različne krvne preiskave. Pred začetkom zdravljenja je treba oceniti bodisi aktivnost tiopurin metiltransferaze (TPMT) bodisi genetsko zaporedje, ki kodira TPMT. Bolnikov z nizko aktivnostjo TMPT ne smemo zdraviti z azatioprinom, ker bi lahko imeli pri dajanju tega zdravila več toksičnih učinkov.