Če imate hudo okužbo netopirjev, se večina strokovnjakov strinja, da je najboljša stvar najeti strokovno podjetje za odstranjevanje netopirjev. Ti ljudje bodo ugotovili, kje se netopirji prenočijo in kako vstopijo in izstopijo, nato pa bodo sprejeli ukrepe, da netopirji odidejo, ne da bi jim dovolili vrnitev. Celoten postopek običajno traja največ nekaj tednov in ko je končan, ne bi smeli imeti več težav z netopirji. Če se poskušate spopasti z enim netopirjem, lahko to pogosto rešite tako, da preprosto odprete okna in pustite netopirja za nekaj časa pri miru. Včasih boste morda želeli poskusiti ujeti netopirja z zaščitnimi rokavicami in mrežo, vendar je to lahko nevarno in verjetno bi bilo varneje poklicati nadzor živali, če je mogoče.
Eden od glavnih razlogov, zakaj se ljudje poskušajo znebiti netopirjev, je, da lahko prenašajo steklino in nekaj drugih bolezni. Včasih lahko te stvari prenesejo na ljudi z ugrizi. Napadi netopirjev niso tako pogosti in na splošno je precej redko, da netopirji zbolijo za steklino, vendar se še vedno običajno šteje, da je vredno skrbeti. Pogosto je dober razlog, da se poskusite znebiti netopirjev, če imate okužbo.
Številna področja imajo zakone, ki prepovedujejo ubijanje kot način, da se znebite netopirjev. Pogosto so pomemben del številnih ekosistemov zaradi svoje nagnjenosti k prehranjevanju žuželk. Morda obstaja nekaj načinov za ubijanje netopirjev, a tudi poleg etičnih in pravnih vprašanj se večina strokovnjakov strinja, da to v resnici ni praktičen način ravnanja z njimi.
Običajno priporočamo, da poiščete strokovnega strokovnjaka za izključitev, da se znebi netopirjev, zaradi varnostnih vprašanj, povezanih z ravnanjem z netopirji, in strokovnega znanja, ki je potrebno za iskanje njihovih skrivališč. Včasih je potrebno veliko spretnosti, da natančno ugotovite, kako netopirji vstopajo in izstopajo iz stavbe, in morda boste imeli težave pri tem, da to storite sami. Res je tudi, da če je treba netopirje odstraniti ročno, je to lahko precej nevarno.
Glavna metoda ravnanja z netopirji se imenuje izključitev. V bistvu vključuje uporabo loput ali drugih enosmernih naprav za zapiranje vhodov v vašo hišo. Netopirji morajo iti na prosto, da najdejo dovolj žuželk za jesti, zato jih bo večina vsak večer zapustila vaš dom, da bi se nahranila. Izključitvene naprave pustijo netopirjem izstop, vendar jim onemogočajo vrnitev. Po naravnem procesu izločanja bo to povzročilo dom brez netopirjev v nekaj tednih in morda veliko prej.