Mnenja o tem, kako pogosto bi morali kopati morskega prašička, se med strokovnjaki razlikujejo. Nekateri menijo, da morski prašički sploh ne potrebujejo kopanja, drugi pa menijo, da jih je treba kopati vsaj enkrat na tri do štiri mesece. Morski prašički so naravno čiste živali, ki so sposobne negovati same sebe, vendar se lahko občasno umažejo. Če njihove kletke niso čiste, je veliko večja verjetnost, da se bodo dovolj umazale, da bi se lahko kopale. Morda bi bilo najbolje, da upoštevate nasvet svojega veterinarja o tem, kako pogosto kopati morskega prašička, če je to nekaj, kar vas še posebej zanima.
Ne pozabite, da lahko prepogosto kopanje morskega prašička dejansko razdraži in izsuši njegovo kožo. Zaradi tega bi bilo treba kopanje verjetno zmanjšati na minimum, če se za to sploh odločite. Ko kopate morskega prašička, lahko razmislite o uporabi neparazitskega šampona na njegovem kožuhu, saj so paraziti občasno težava pri teh živalih. Šampon proti parazitom je na splošno priporočljiv, tudi če niste prepričani, ali ima vaš morski prašiček parazite, ker jih ni vedno lahko opaziti. Čeprav mnogi odsvetujejo, da teh živali sploh ne kopajo, se večina strinja, da je kopanje pomembno, če je jasno, da je morski prašiček preplavljen s paraziti.
Tudi če se odločite, da morskega prašička ne boste kopali, ga lahko še vedno očistite z vlažno, milno krpo, ko se vam zdi potrebno. Čeprav so morski prašički ponavadi naravno čisti, lahko občasno končajo z iztrebki ali drugimi ostanki iz svojih kletk na krznu. Ne pozabite uporabiti blaga mila na krpi, če se odločite, da boste svojega ljubljenčka očistili na mestu, saj lahko trda mila zelo dražijo njegovo kožo.
Če bo vaša kletka morskega prašička vedno čista, bo potreba po kopeli zelo zmanjšana. Steljo je treba zamenjati vsak dan, če je le mogoče, celotna kletka pa bo verjetno potrebovala temeljito čiščenje vsaj enkrat na teden. Za čiščenje kletke lahko uporabite katero koli čistilno raztopino. Nekateri ljudje uporabljajo običajno milo, drugi pa majhne količine klorovega belila razredčijo z vodo, da učinkovito uničijo bakterije. Ne glede na to, s čim čistite kletko, se prepričajte, da jo temeljito prezračite, preden svojega morskega prašička vrnete noter.