Skrb za bonsaj ciprese je lahko odvisna od izbrane vrste drevesa, saj je na voljo več kot 100 različnih sevov cipres za usposabljanje kot bonsaj. Priljubljene različice bonsaj ciprese vključujejo Lawson – Chamaecyparis lawsoniana, japonski Hinoki – Chamaecyparis obtuse in japonsko Sawara – Chamaecyparis pisifera. Druga pogosta vrsta bonsaj ciprese, ki je priporočljiva za začetnike, čeprav ni prava vrsta cipres, je plešasta ali močvirska cipresa – Taxodium distichum. Skrb za ciprese je zato lahko različna, saj so nekateri raje suhi podnebni pogoji, kot je japonski Hinoki, nekateri pa so doma v močvirnih regijah in imajo raje stalno mokro okolje, kot je plešasta cipresa. Splošno pravilo pa je, da je ciprese enostavno gojiti kot bonsaj, zato so od leta 2011 postale zelo priljubljena izbira in so drevesa, ki imajo raje polno sončno svetlobo in redno gnojenje.
Večina vrst cipres je razmeroma odpornih, zato iz njih naredijo dobre vzorce bonsajev, saj je prilagajanje drevesa bonsajskemu načinu življenja lahko stresen proces za drevo. Glede na pogostost zalivanja je cipresa Hinoki vrsta, ki zahteva najbolj suhe pogoje. Tla za Hinoki bi morala biti večino časa vlažna, vendar je vrsta, ki je odporna na sušo, ki lahko preživi hladnejše in bolj suhe razmere kot drugi bonsaj ciprese. V tem spektru cipresa Sawara potrebuje več vode, saj je doma na vlažnih območjih, plešasta cipresa pa zahteva skoraj stalno stanje mokre prsti, saj je doma iz močvirja. Drevesa sawara in plešaste ciprese lahko tudi umrejo, če so izpostavljene hladnim razmeram in jih je treba prezimiti v rastlinjakih.
Bonsaji so na splošno lahko nagnjeni k pogostejšim napadom škodljivcev in bolezni kot njihovi sorodniki v naravi zaradi omejenih razmer, v katerih se gojijo. Medtem ko je drevo Hinoki dokaj odporno na škodljivce in bolezni, so sawara in plešaste ciprese pogosto napadene s koreninskimi listnimi uši in imajo občutljive veje, ki jih je treba obrezati tako, da jih ščipate s prsti, namesto da jih odrežete, da preprečite nepotrebno škodo na drevesih. Cipresa Lawson, ki je ena izmed najbolj priljubljenih sort cipres, ki se gojijo, zahteva tudi stalno vlažno zemljo, kot je Sawara, ne pa tudi pogojev z vodo, ki jih uživa plešasta cipresa. Eden od pogojev rasti, ki je skupen vsem priljubljenim bonsajem ciprese, je, da imajo vsi raje polno sončno svetlobo, kar pogosto pomeni, da je same posode za bonsaj najbolje vzdrževati na prostem.
Plešasta cipresa je dobila ime po tem, da je edinstveno listopadno drevo iglavcev, ki v zimskem času izgubi svoje iglaste liste. Listje bo najprej postalo oranžno in nato rjavo, kar bi pri drugih bonsajih cipres pomenilo, da drevo umira. V Plešasti cipresi je to naraven jesenski dogodek. Določanje ustreznega nivoja vode za plešasto cipreso lahko izvedete tudi tako, da opazujete učinke povešenosti na novem listju, kar kaže, da potrebuje več vode.
Priporočljivo je tudi, da se sajenje bonsaj ciprese ponovi vsake dve do tri leta za vse vrste, čeprav nekatere rastejo hitreje kot druge. Hinoki raste najpočasneje, zato ga je mogoče presaditi manj pogosto kot sorte, kot je Sawara. Plešasta cipresa raste najhitreje in jo lahko vsako leto varno presadite. Ker je lubje bonsaj ciprese lahko občutljivo, je treba paziti tudi na ožičenje dreves, da zrastejo v določene oblike. Ko se žica zategne, jo je treba odstraniti in zamenjati z ohlapnejšimi navitji ali jih sploh ne.