Med endometriozo in sindromom policističnih jajčnikov (PCOS) je veliko razlik. Ena od glavnih razlik je del telesa, ki je vključen. Endometrioza je v bistvu stanje, pri katerem se vrsta tkiva, ki običajno obdaja žensko maternico, nahaja zunaj maternice; to pogosto povzroča bolečine, neplodnost in močne krvavitve. Po drugi strani pa PCOS prizadene predvsem ženske jajčnike. Zaznamujejo ga številne ciste v ženskih jajčnikih in vrsta drugih simptomov, vključno z neplodnostjo, aknami, povečanjem telesne mase in nerednimi menstruacijami.
Oseba je lahko zmedena glede razlike med PCOS in endometriozo, ker so pogoji podobni na več pomembnih načinov. Za začetek so to stanja, ki prizadenejo samo ženske in povzročajo težave z ženskim reproduktivnim sistemom. Prav tako sta obe težavi, ki lahko povzročita neredne menstruacije. Poleg tega lahko oba stanja povzročita ali prispevata k težavam s plodnostjo pri prizadetih ženskah. Poleg tega pa sta dva pogoja zelo različna.
Glavna razlika med PCOS in endometriozo je prizadeti del reproduktivnega sistema. Pri PCOS je težava osredotočena na jajčnike. Endometrioza pa vključuje endometrijsko tkivo, ki se pojavi zunaj maternice in prizadene druge organe v medenici. Na primer, lahko raste na jajčnikih, lahko pa vpliva tudi na vrsto drugih organov. Poleg tega se lahko tkivo oblikuje na sluznici medenične votline in drugih strukturah.
Simptomi so še en način, v katerem se PCOS in endometrioza razlikujeta. Med pogostimi simptomi PCOS so majhne ciste na jajčnikih, neplodnost, akne in neredne menstruacije ali odsotnost menstruacije. Nekatere ženske s tem stanjem imajo tudi težave, povezane z insulinom, povišan krvni tlak in raven holesterola ter pridobivanje telesne teže. Simptomi endometrioze vključujejo bolečine v medenici, bolečine v spodnjem delu hrbta in spremembe gibanja črevesja. Drugi simptomi lahko vključujejo težje od običajnih menstrualnih krvavitev, nepravilne vaginalne krvavitve, neplodnost in kri v urinu.
Znanstveniki niso 100-odstotno prepričani, zakaj pride do PCOS in endometrioze, vendar se domnevni vzroki razlikujejo. Znanstveniki na primer menijo, da je endometrioza posledica kopičenja menstrualne krvi v ženski medenici in trebuhu. Nekateri tudi teoretizirajo, da so v ženski medenici primitivne celice, ki imajo potencial za tvorbo endometrijskega tkiva. Obstajajo celo nekatere študije, ki kažejo na težave z odzivom imunskega sistema kot vzrok za endometriozo.
Znanstveniki verjamejo, da lahko PCOS povzročijo hormonske nenormalnosti, ki spodbujajo razvoj cist in ovirajo normalno ovulacijo. Težave z načinom, kako telo obdeluje krvni sladkor, lahko igrajo tudi vlogo. Morda obstaja celo genetska povezava za ženske, ki imajo PCOS, saj imajo ženske, ki imajo to bolezen, pogosto tudi bližnjo sorodnico, ki jo ima.