Uspešno zdravljenje bakterijske okužbe želodca lahko vključuje več običajnih zdravljenj, ne glede na vrsto bakterije. Ubijanje bakterij je ključno, vendar je želodec organ s občutljivim ravnovesjem. Zato je lahko koristno tudi začasno jemanje zdravil, ki bodo zmanjšala želodčno kislino, medtem ko se želodec zdravi in se to ravnovesje vzpostavi.
Gastroenteritis je pogosta bakterijska okužba želodca, ki se pojavi, ko posameznik poje slabo hrano ali pije kontaminirano vodo. Eden najpomembnejših načinov za zdravljenje tega stanja je uživanje ledu in pitje tekočin, kot je sadni sok, da se nadomestijo vitalne hranilne snovi in tekočine, izgubljene med napadi driske, ki spremljajo okužbo. Sladka hrana, kot sta toast in krompir, bo prav tako pomagala umiriti želodec. Če lahko zdravnik natančno ugotovi, katere bakterije povzročajo gastrointestinalne težave, se lahko predpišejo antibiotiki. V večini primerov pa zadostujeta tekočina in navadna prehrana, da posameznika preživi bolezen, ko teče.
Nekatere vrste razjed povzroča tudi bakterijska okužba v želodcu. Peptične razjede so lahko boleče stanje, pri katerem bakterije začnejo jesti skozi želodčno sluznico. Za uničenje bakterij se pogosto predpisujejo antibiotiki, za obvladovanje simptomov in dajanje možnosti za ozdravitev želodca pa se lahko uporabljajo tudi druge vrste zdravil. Tiste, ki vsebujejo bizmut, se lahko uporabijo za ustvarjanje zaščitne prevleke, ki zagotavlja dodatno zaščito pred želodčno kislino. Lahko jemljete tudi zdravila, podobna tistim, ki preprečujejo zgago in refluks kisline, ki bodo pomagala zmanjšati količino proizvedene želodčne kisline.
Nekatere vrste zdravil lahko obrabijo zaščitno prevleko v oblogi, zaradi česar je bolj ranljiva za poškodbe, ki jih povzročijo bakterijske okužbe. Na splošno je priporočljivo, da se med okrevanjem po takih okužbah izogibate aspirinu. Alkohol in izpostavljenost cigaretnemu dimu lahko tudi podaljšata bolezen in otežita premagovanje okužbe.
Po drugi strani pa lahko nekatera živila pomirjajo posameznika z bakterijsko okužbo želodca. Jogurt, zlasti tiste vrste, obogatene s probiotiki, lahko pomaga pomiriti jezen želodec. Nekateri vitamini lahko pomagajo telesu pri boju proti bakterijski okužbi s krepitvijo imunskega sistema. Povečanje količine vitamina A v prehrani ali jemanje dodatkov lahko pomaga imunskemu sistemu pri napadu na bakterijske napadalce.