Včasih je težko ugotoviti, kakšna je najboljša ločljivost mikroskopa za uporabo, zlasti za nove mikroskopiste. Obstajajo pa tri preproste smernice, ki lahko pomagajo tudi najbolj surovim začetnikom izbrati najboljšo ločljivost mikroskopa. Smernice so, da izberete ločljivost, ki ne bo poškodovala vašega primerka, izberete ločljivost, ki predstavlja največjo količino želene vsebine v vidnem polju, in izberete ločljivost, ki omogoča jasen pogled na predmet. Te tri smernice bodo podrobneje pojasnjene spodaj.
Najprej se prepričajte, da izberete ločljivost, ki ne bo poškodovala vzorca. Toda kako lahko izbira posebne ločljivosti poškoduje vzorec? Eden od načinov je skozi olje. Leče z zelo visoko ločljivostjo zahtevajo uporabo olja ali drugih tekočin, ki lahko poškodujejo vzorce ali uničijo stekelce, ki niso ustrezno pripravljeni. Drug način, kako se lahko primerek poškoduje, je fizična sila. Če je leča mikroskopa prevelika, lahko pritisne na vzorec in ga zdrobi, če uporabnik ni previden. Te dejavnike je treba upoštevati pred uporabo objektiva za doseganje določene ločljivosti.
Drugič, izberite ločljivost, ki predstavlja največjo količino želene vsebine v vidnem polju. Če lahko mikroskopist vidi le majhen delček nečesa v kotu okularja, potem je verjetno treba uporabiti višjo ločljivost. Dokler se vzorec ne poškoduje in čas to dopušča, bi lahko mikroskopist poskusil z višjo ločljivostjo, da bi ugotovil, ali omogoča videti več želenega predmeta.
Tretjič, uporabite ločljivost, ki omogoča jasen pogled na zadevo. Če mikroskopist subjekta ne vidi jasno, ni pomembno, koliko ga je v vidnem polju. Vsakič, ko se poveča ločljivost, bo za pravilno videnje predmeta potrebno več svetlobe; če ni na voljo več svetlobe, je treba uporabiti nižjo ločljivost. Tudi, če mikroskopist ne more izostriti predmeta (mehke) pri določeni ločljivosti, je treba uporabiti drugačno ločljivost.
Poleg teh treh smernic si pri izbiri najboljše ločljivosti mikroskopa zapomnite standardne prakse mikroskopa. Začnite pri najnižji možni ločljivosti in izostrite predmet. Pomaknite se na naslednjo najnižjo ločljivost in po potrebi prilagodite fokus in osvetlitev. Nato sledite trem smernicam, dokler ne določite najboljše ločljivosti mikroskopa.