Najboljši naravni grški jogurt je tisti, ki je gost, kremast in brez dodatkov in konzervansov. Pristni naravni grški jogurt ne vsebuje zgoščevalcev, kot sta želatina ali koruzni škrob, ampak je naravno gost zaradi procesa odcejanja tekoče sirotke. To koncentrira in poveča beljakovine v škatli jogurta, vendar rahlo zmanjša kalcij. Najboljši naravni grški jogurt je morda dražji od drugih vrst, saj je za izdelavo potrebnih približno trikrat več mleka.
Grški jogurt je bogat s hranili in prijaznimi bakterijami. Tako navadni kot naravni grški jogurt je narejen tako, da se v mleko dodajo kulture živih bakterij Streptococcus thermophilus in Lactobacillus bulgaricus, da se fermentira. Tekoča sirotka se nato odstrani iz grškega jogurta, da se konsistenca zgosti. Primerjava škatle navadnega jogurta s škatlo naravnega grškega jogurta kaže, da je v grškem jogurtu več kalorij in bistveno več beljakovin, vendar manj kalcija v primerjavi z navadnim jogurtom.
Jogurti z dolgim seznamom sestavin so tisti, ki so jim dodali polnila, kot so zgoščevalci, sladila ter umetne arome in barve. Te sestavine zmanjšajo dobroto in povečajo število kalorij, zato je najboljši jogurt za nakup tisti z najmanj sestavinami. Pri naravnem grškem jogurtu naj bodo to mlečna smetana, jogurtna kultura ter kravje ali ovčje mleko. Na škatli mora biti nalepka, ki označuje, da je kultura jogurta živa in aktivna.
Probiotiki ali žive kulture so prisotni v vseh naravnih grških jogurtih. Spodbujajo celično imunost, izboljšajo zdravje črevesja in povečajo dober holesterol. Čeprav so vsi jogurti narejeni z uporabo bakterijskih kultur, nimajo vsi enake količine. Oznaka »živa kultura« na škatli pomeni, da jogurt vsebuje znatno količino kulture na gram izdelka. Nekatera podjetja dodajajo dodatne probiotike in kulture, da bi promovirala jogurt kot še bolj koristna za imuniteto in zdravje prebave. Nekateri jogurti so po fermentaciji toplotno obdelani, kar bo uničilo večino koristnih bakterij.
Naravni jogurt brez dodanih sestavin, ki ni toplotno obdelan in nosi oznako »živa kultura«, bo vedno najbolj zdrava možnost. Razen tega gre le za primer okusa. Nekaterim ljudem, ki so vajeni sladkanih izdelkov, se morda zdi okus naravnega grškega jogurta nekoliko oster ali kiselkast, vendar sta kremnost in tekstura za večino primerna kompenzacija.